New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1419553 = | 31 (0.350) | 7 (0.110) | 6/184 | NT | 26.0% | intergenic (‑36/+101) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1419647 = | 17 (0.260) | intergenic (‑130/+7) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAAC > NC_002947/1419405‑1419702 | tCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGG > 2:488073‑M1/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGG < 2:1695872‑M1/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGG > 2:12747‑M1/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGG > 1:92321‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGC < 1:372142‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCAGGC < 1:1149793‑M1/150‑1 (MQ=255) atgcaaacccaccgcccacagctggatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcag > 2:1755501‑M1/150‑150 (MQ=255) actcaaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcag > 1:1183898‑M1/150‑150 (MQ=255) tgaaccccaccgcccacagcgcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggcaggtcgagtcggcgttgatgcagttggaggtggggtagcatgtacccacggtgcctcacaccttgccttagcaggtccGGc > 2:340447‑M1/148‑150 (MQ=255) tcaaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgcgtcggcgttgatacagttgcagatgcggacgcatttacgcacagcgccccacaccttgaattatctggtcaggg < 2:1232‑M1/3‑2 (MQ=255) tcaaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGc < 2:1840881‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGc > 2:362680‑M1/148‑150 (MQ=255) tcaaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGc > 2:757965‑M1/148‑150 (MQ=255) aaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCct < 1:1341093‑M1/5‑1 (MQ=255) gATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGG < 1:488073‑M1/150‑1 (MQ=255) gATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGG < 1:1667944‑M1/150‑1 (MQ=255) ccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggttctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTcgcg > 2:316857‑M1/139‑150 (MQ=255) cgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCgg > 2:1782973‑M1/138‑150 (MQ=255) cGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGG < 2:640970‑M1/145‑1 (MQ=255) cGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGG > 1:640970‑M1/1‑145 (MQ=255) cGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTG < 2:761203‑M1/133‑1 (MQ=255) acagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACg < 1:628788‑M1/18‑1 (MQ=255) tGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC > 1:1524265‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTccc < 1:708844‑M1/27‑1 (MQ=255) ggAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCA < 1:1747373‑M1/148‑1 (MQ=255) ggAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCA > 2:1747373‑M1/1‑148 (MQ=255) cgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca > 1:1608915‑M1/123‑150 (MQ=255) gtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 2:1729012‑M1/29‑1 (MQ=255) gAACAGCGGCTGAGTGTTGTTTTCCCCTTGCTACAAGCAGGTCTTCCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTTCCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt < 2:179796‑M1/150‑2 (MQ=255) gggcaGTGGTGTTGTAGCCGTTGTAGACGCTGGTCTTCTTGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGGGGGGATT‑GGTTTGTTTCCCCGGA‑TTCTGGGTGGGTTGTGGTGGCCTCTTCGCGGGCAGGCCTGGTCCCACATGTTCtgtg < 2:443212/146‑1 (MQ=255) gTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGC > 2:884679‑M1/1‑121 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTTTGCa < 1:829096/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGGGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 1:724170/150‑1 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCTTGGGCTGGCCTCTTCGCGG > 1:2028700‑M1/1‑118 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCTTGGGCTGGCCTCTTCGCGG < 2:2028700‑M1/118‑1 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGc > 1:1469579/1‑150 (MQ=255) gttgttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGCGTTATCGGT‑‑GCATTAGCAAAGGTACTGGAAACTACGGGGGGTCGTGGGCT‑GCCTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTTCAGTGCGt > 2:1433167/1‑150 (MQ=255) ttgttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtc > 2:1450980‑M1/1‑135 (MQ=255) atgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTg < 2:1831998‑M1/48‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgtg > 2:1372331/1‑150 (MQ=255) ttGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCt < 2:2259059/146‑1 (MQ=255) ttGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCt > 1:2259059/1‑146 (MQ=255) gcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCa > 1:1525600‑M1/92‑107 (MQ=255) gcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCa < 2:1525600‑M1/16‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgtg > 1:1959953/1‑146 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGa < 2:2121421/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGa < 1:258380/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGAATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 1:859649‑M1/1‑120 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGAATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 2:859649‑M1/120‑1 (MQ=255) tacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCt > 1:1272087‑M1/88‑111 (MQ=255) tacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCt < 2:1272087‑M1/24‑1 (MQ=255) aGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctg > 1:1435336‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtg > 1:1550877‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtg > 1:618050‑M2/1‑144 (MQ=255) ggggcTTGCCGCCTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCGGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTgg < 2:531039/146‑1 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg > 1:1356810‑M2/1‑143 (MQ=255) gggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac > 2:2270389‑M1/83‑111 (MQ=255) gggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 1:2270389‑M1/29‑1 (MQ=255) ggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTgg > 1:2302719‑M1/82‑150 (MQ=255) ggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTgg > 2:1773951‑M1/82‑150 (MQ=255) gTCTTGCCGCCTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtggga > 1:160874‑M2/1‑141 (MQ=255) gTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtggga < 2:1524265‑M1/150‑40 (MQ=255) gTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtggga > 2:2043808‑M2/1‑141 (MQ=255) gTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTG > 1:2043075‑M1/1‑80 (MQ=255) gTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTG < 2:2043075‑M1/80‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCCGAGGTCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtggga > 2:1549898‑M2/1‑141 (MQ=255) tCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggag > 1:750380‑M2/1‑140 (MQ=255) cTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagc < 1:1450980‑M1/150‑42 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgt < 1:2009158‑M1/143‑36 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgt > 2:2009158‑M1/1‑108 (MQ=255) tGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATTggcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg < 1:1573425‑M1/150‑44 (MQ=255) tcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCgg > 1:1831998‑M1/76‑150 (MQ=255) cgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCggg > 2:708844‑M1/75‑150 (MQ=255) gagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacatagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGc > 1:2090345‑M1/74‑150 (MQ=255) gACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgt > 2:1526409‑M2/1‑133 (MQ=255) tggGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtg > 1:592221/1‑118 (MQ=255) tggGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtg < 2:592221/118‑1 (MQ=255) gTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaga > 1:1922237‑M2/1‑122 (MQ=255) tgttgtgtttGCGGTTGTCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcggaaaggcc < 2:1844109‑M2/150‑33 (MQ=255) tgttgtCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGa < 1:169450/100‑1 (MQ=255) tgttgtCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGa > 2:169450/1‑100 (MQ=255) atttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 1:834851‑M1/32‑1 (MQ=255) atttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:834851‑M1/40‑71 (MQ=255) ttttgtttCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCAGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagc > 2:1643727‑M1/1‑65 (MQ=255) cccTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgt < 2:729000‑M2/92‑6 (MQ=255) cccTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgt > 1:729000‑M2/1‑87 (MQ=255) ccTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt < 1:80265/60‑1 (MQ=255) ccTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt > 2:80265/1‑60 (MQ=255) cTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcg > 1:1127745‑M2/1‑85 (MQ=255) cTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcg < 2:1127745‑M2/101‑17 (MQ=255) cTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg > 2:1318043‑M2/1‑85 (MQ=255) cTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg < 1:1318043‑M2/92‑8 (MQ=255) cTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgg < 1:1317529‑M2/92‑8 (MQ=255) cTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGAGAAGAGGCATGACCTACTGATGCGAGGTGTGAGGCTCTGTgg > 1:1232/1‑150 (MQ=37) tGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCtgt > 2:2322572/1‑140 (MQ=255) tGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCtgt < 1:2322572/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACt < 2:2081120/49‑1 (MQ=255) gCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaga < 2:2098974‑M2/93‑29 (MQ=255) gCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaga > 1:2098974‑M2/1‑65 (MQ=255) ggCCTTTCCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccagcccaggcaacccagaatccagggaaacaaaacaatgacaaccgcaaacacaaca < 2:1844109‑M1/150‑119 (MQ=255) | TCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATT‑GTTTTGTTTCCCTGGA‑TTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAAC > NC_002947/1419405‑1419702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |