New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1648974 = | 84 (0.950) | 8 (0.110) | 7/214 | NT | 9.9% | intergenic (‑211/+85) | oprB‑II/PP_1446 | carbohydrate‑selective porin/TonB‑dependent receptor |
? | NC_002947 | 1649030 = | 73 (0.960) | intergenic (‑267/+29) | oprB‑II/PP_1446 | carbohydrate‑selective porin/TonB‑dependent receptor |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TCAATGGATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGG > NC_002947/1648824‑1649122 | tcggaggATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGT‑ACAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCCACAGTCGGCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGc > 1:672040/6‑150 (MQ=255) tCAATGGATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGc < 1:1128505/150‑1 (MQ=255) aaTGGATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCgg > 1:78724/1‑150 (MQ=255) aaTGGATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCgg < 2:1327795/150‑1 (MQ=255) aaTGGATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCgg > 1:1281495/1‑150 (MQ=255) gcgtttgtgcgcggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaac < 2:769783‑M1/1‑1 (MQ=255) tttgtgcgcggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCggg > 2:339103‑M1/147‑150 (MQ=255) gtgcgcggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTc < 2:206882‑M1/7‑1 (MQ=255) tGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCAccc > 1:173991/1‑150 (MQ=255) ggCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCcg > 1:1153533/1‑150 (MQ=255) gcgcggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCAc > 1:769783‑M1/142‑150 (MQ=255) gcgcggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccgggccgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCAc > 1:1225528‑M1/142‑150 (MQ=255) gCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc > 1:439425/1‑150 (MQ=255) gCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 2:2336020/150‑1 (MQ=255) gcggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCAccc > 1:1977203‑M1/140‑150 (MQ=255) ggcgaaaacctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcccctgttccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCACCcgc > 2:71191‑M1/138‑150 (MQ=255) gTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCgg > 2:1383658/1‑150 (MQ=255) cctgaccgaccagaccgtgcgctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagataggtgtaggagCGGGTTCACCCGCGAATgcgc < 2:2013648‑M1/21‑1 (MQ=255) 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ttGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGc > 2:2097390/1‑107 (MQ=255) ttGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGc < 1:2097390/107‑1 (MQ=255) gctatgccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTAt < 1:1203642‑M1/41‑1 (MQ=255) cggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCgg < 1:1580048/150‑1 (MQ=255) gccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTcgcg > 1:351125‑M1/105‑150 (MQ=255) ccagttcgatcctgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTattcgagg > 2:1203642‑M1/104‑147 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tataGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTc > 2:433131/1‑150 (MQ=255) ataGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTcc < 2:1761497/150‑1 (MQ=255) tgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgttccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCggg > 1:2163890‑M1/92‑95 (MQ=255) tgcgcgatatcgcaccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgttccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCggg < 2:2163890‑M1/4‑1 (MQ=255) aGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTc < 1:765823/147‑1 (MQ=255) ggAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTacac < 1:1122793/150‑1 (MQ=255) taAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGTTAGACGCGGTGGGGCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTGCCTACACCGATCTtc < 2:1153533/150‑1 (MQ=255) taAGAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTtc > 2:2174096/1‑150 (MQ=255) aaaGAAAAAAGACAACTTGTC‑TAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GCGGCGGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTtc < 2:439425/149‑1 (MQ=39) gAAAAAAGACAAATTGTC‑CAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTtcgtc > 2:203148/1‑150 (MQ=255) ccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCACCcgc < 2:918136‑M1/13‑1 (MQ=255) ccggcgccggggcgtagcgtggaagtcgggttgcgtaccaccttctgaaccacaagcgacgaagatcggtgtaggaaCGGGTTCACCcgc > 1:918136‑M1/78‑90 (MQ=255) 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tcgtcATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGTATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtg < 1:623517/123‑1 (MQ=255) tcgtcATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGTATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtg > 2:623517/1‑123 (MQ=255) gtcATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtggt > 2:1526921/1‑123 (MQ=255) tcATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGcccc < 1:1189420/150‑1 (MQ=255) aTC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGcc > 1:2298097/1‑150 (MQ=255) aGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTg < 1:1383658/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGc < 2:1957275/149‑1 (MQ=255) gCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGc > 1:1957275/1‑149 (MQ=255) cAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGcaa < 2:1787808/150‑3 (MQ=255) cAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGa < 1:2174096/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCAc < 1:565371/125‑1 (MQ=255) gtgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGatat > 2:765397/1‑150 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTtgtg < 1:693948/90‑1 (MQ=255) gtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTtgtg > 2:693948/1‑90 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCgcgc > 1:727567/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggt > 1:1862815/1‑97 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggt < 2:1862815/97‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa > 2:1508620/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa < 2:446781/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGTTTCAGAAGGTGGTACGCAACACGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGGGATATCGCGCAgg > 1:281416/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAgg < 1:3387/150‑1 (MQ=255) | TCAATGGATATGGCGACAAGATTGTTCGATGAAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATC‑‑GAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGG > NC_002947/1648824‑1649122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |