New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2635482 | 72 (0.820) | 4 (0.050) | 6/224 | NT | 5.3% | intergenic (+29/+88) | PP_2304/PP_2305 | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase D/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2635487 | 79 (0.990) | intergenic (+34/+83) | PP_2304/PP_2305 | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase D/hypothetical protein |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCCACCGACGAAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAGGGCGA > NC_002947/2635337‑2635631 | gccACCGACGAAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCg > 1:1055203/1‑150 (MQ=255) gccACCGACGAAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCg > 1:366341/1‑150 (MQ=255) cACCGACGAAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTg < 2:948071‑M2/150‑2 (MQ=255) aCCGACGAAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTgc > 2:545043‑M2/1‑148 (MQ=255) gacgaAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTgcggc > 1:948071‑M2/1‑145 (MQ=255) agaAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTACATGAAGAAACAGGCCG‑Cacgaggcggcctgtttc > 1:1273309‑M1/1‑133 (MQ=255) aaGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTc > 2:114308/1‑134 (MQ=255) aaGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTc < 1:114308/134‑1 (MQ=255) agcagATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTc > 1:964858/1‑150 (MQ=255) gATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCa < 2:2223828/150‑1 (MQ=255) tcgtctcTACCTCGCGTCACGTGCTTGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGcc < 2:872332/144‑1 (MQ=255) cTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACgg > 2:1460025/1‑150 (MQ=255) cTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAACAAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACgg > 2:206928/1‑150 (MQ=255) tCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGt > 1:1216711/1‑150 (MQ=255) tCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGt < 2:1055203/150‑1 (MQ=255) gcgTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCa > 1:896394/1‑150 (MQ=255) cgTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTACATGAAGAAACAGGCCG‑CA‑CGAggcggcctgtttcttcatgcaacgaacaccttagtaacgg > 2:1273309‑M2/1‑110 (MQ=255) cACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCCCAAGTTAATAAGGTGCTCCTTGCATGACGAAACAGGTCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTCCTTTTTCGTCAGCCGCGAGCACGGTCATTGt < 2:1434001/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cagGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTg > 2:2064906/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAg < 2:1503674/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAg < 1:2064906/150‑1 (MQ=255) cGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CA‑CGAggcggcctgtttcttcat < 1:1119971‑M2/100‑19 (MQ=255) cGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CA‑CGAggcggcctgtttcttcat > 2:1119971‑M2/1‑82 (MQ=255) gCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTg < 2:366341/150‑1 (MQ=255) cTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTgcggcctgtttc < 2:1787946‑M2/93‑13 (MQ=255) cTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTgcggcctgtttc > 1:1787946‑M2/1‑81 (MQ=255) cTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTgg > 2:1366370/1‑150 (MQ=255) ccGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCACACGTCTGGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCt > 1:733354/1‑150 (MQ=255) cGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACgg > 2:1300876/1‑111 (MQ=255) cGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACgg < 1:1300876/111‑1 (MQ=255) agcTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGt > 2:1973591/1‑150 (MQ=255) gAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTAc > 2:1369643/1‑150 (MQ=255) cAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTc > 1:127769/1‑77 (MQ=255) aaTGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTc > 1:724629/1‑150 (MQ=255) gCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACATGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGATCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTGCAcc < 2:1682957/150‑1 (MQ=255) aTCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCa > 1:1187139/1‑150 (MQ=255) aTCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCa > 1:1974351/1‑150 (MQ=255) aTCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCa > 2:2305233/1‑150 (MQ=255) aCCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATaa < 1:942915/150‑1 (MQ=255) cccGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAAc > 1:1890019/1‑150 (MQ=255) ccGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCGCCtcgtgcggcctgtttcttcatgtaacgaacaccttagtaacgggtgatgtctgcattggcttccagctgcttgcggtaagcggcaaagtcctgctggccagcacgtgacg > 2:1273309‑M1/1‑40 (MQ=255) ccGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGTGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCAc > 2:1844615/1‑138 (MQ=255) ccGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCAc < 1:1844615/138‑1 (MQ=255) ccGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACt > 1:649779/1‑150 (MQ=255) gTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTaa > 1:2247512/1‑117 (MQ=255) gTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTaa < 2:2247512/117‑1 (MQ=255) ttACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTc < 1:2013093/150‑1 (MQ=255) 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cAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGcccc > 1:1997547/1‑150 (MQ=255) aGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCa > 2:1532879/1‑150 (MQ=255) gccg‑ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCATGGTTGGCGCTAACCAGGCGCTACCAACTGACCTCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCACCAgg > 1:2272702/1‑150 (MQ=255) gccg‑ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAgg > 1:2153826/1‑150 (MQ=255) gCCG‑Cacgaggcggcctgtttcttcatgcaacgaacaccttagtaacgggtgatgtctgcattggcttccagctgcttgcggtaagcggcaaagtcctgctggccagcacgtgacgcgaggtagcggcgaatctgctgcttctcttcgtc > 1:948071‑M1/1‑5 (MQ=255) ccg‑ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAggg > 2:1869064/1‑150 (MQ=255) g‑Cacgaggcggcctgtttcttcatgcaacgaacaccttagtaacgggtgatgtctgcattggcttccagctgcttgcggtaagcggcaaagtcctgctggccagcacgtgacgcgaggtagcggcgaatctgctgcttctcttcgtcggt > 2:545043‑M1/1‑2 (MQ=255) ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAGGGCGa > 1:1889098/1‑150 (MQ=255) ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAGGGCGa > 1:1446819/1‑150 (MQ=255) ccTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAGGGCGa > 2:1853358/1‑150 (MQ=255) cacgaggcggcctgtttcttcatgcaacgaacaccttagtaacgggtgatgtctgcattggcttccagctgcttgcggtaagcggcaaagtcctgctggccagcacgtgacgcgaggtagcggcgaatctgctgcttctcttcgtcggtg < 2:948071‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCCACCGACGAAGAGAAGCAGCAGATTCGCCGCTACCTCGCGTCACGTGCTGGCCAGCAGGACTTTGCCGCTTACCGCAA‑GCAGCTGGAAGCCAATGCAGACATCACCCGTTACTAAGGTGTTCGTTGCATGAAGAAACAGGCCG‑CCTCGTGCGGCCTGTTTCGTTTTCGCCAGCCGCGAGCACGGTCATTGTCGAAGGTCACAGTGCCTTCAGGGGTGGCGCTAACCAGGTGCTACCGCTTCACCCCTTCATAACTGTCCAGCGTATCGCGTGCAATCTCTCGCCCCAGGGCGA > NC_002947/2635337‑2635631 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |