| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 3359296 = | 87 (0.990) | 8 (0.100) | 7/226 | NT | 9.8% | coding (430/912 nt) | PP_2955 | CorA family magnesium/cobalt transporter |
| ? | NC_002947 | 3359328 = | 68 (0.850) | coding (398/912 nt) | PP_2955 | CorA family magnesium/cobalt transporter | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTGTTTCTGGCCATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCAC > NC_002947/3359147‑3359440 | gtgtTTCTGGCCATGGCTGGGCAGCAGGTCTAGCACGGCGCCATTGTTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCTGGCTTTTGCTAAGGCTGTACAGCTGCACCGGGTGATGGCTGTCCATGGACCGATAGAACTGCAGCTCAATTTcgcg < 2:1201583/150‑1 (MQ=255) tgtTTCTGGCCATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCgg < 1:1994406/150‑1 (MQ=255) gtcattcggcgttgtactcagcgaaaagcgcctggtggtgatctgcgccgccaactcgctactcgccggggtagaccggcaggccggcatgagtaccccactggatgtgctgatggcgatgctggctgaaagcgtgcatcactacctggg < 1:923750‑M1/3‑1 (MQ=255) gtcattcggcgttgtactcagcgaaaagcgcctggtggtgatctgcgccgccaactcgctactcgccggggtagaccggcaggccggcatgagtaccccactggatgtgctgatggcgatgctggctgaaagcgtgcatcactacctggg < 1:19598‑M1/3‑1 (MQ=255) gtcattcggcgttgtactcagcgaaaagcgcctggtggtgatctgcgccgccaactcgctactcgccggggtagaccggcaggccggcatgagtaccccactggatgtgctgatggcgatgctggctgaaagcgtgcatcactacctggg < 1:2306548‑M1/3‑1 (MQ=255) tttCTGGCCATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGc < 1:571268/150‑1 (MQ=255) ccATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCgg > 1:654574/1‑141 (MQ=255) ccATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCgg < 2:654574/141‑1 (MQ=255) cATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCt > 1:997107/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCtt > 1:1318554/1‑150 (MQ=255) ggCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGACTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTa < 1:352698/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTac > 1:1468238/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTacca < 1:2094115/150‑1 (MQ=255) tcagcgaaaagcgcctggtggtgatctgcgccgccaactcgctactcgccggggtagaccggcaggccggcatgagtaccccactggatgtgctgatggcgatgctggctgaaagcgtgcatcactacctg < 1:1328693‑M1/1‑1 (MQ=255) tcagcgaaaagcgcctggtggtgatctgcgccgccaactcgctactcgccggggtagaccggcaggccggcatgagtaccccactggatgtgctgatggcgatgctggctgaaagcgtgcatcactacctg > 2:1328693‑M1/131‑131 (MQ=255) gcatGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCa < 1:1819817/150‑1 (MQ=255) gggCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGt < 2:130829/150‑1 (MQ=255) ggCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTg > 1:1478914/1‑150 (MQ=255) 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gTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAcccc > 2:2306548/1‑150 (MQ=255) gTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGc > 1:1595989/1‑150 (MQ=255) gTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGc < 2:1804146/150‑1 (MQ=255) tCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATc > 1:2148088/1‑96 (MQ=255) tCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATc < 2:2148088/96‑1 (MQ=255) aTGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGt > 2:984472/1‑150 (MQ=255) aTGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGt > 1:1616690/1‑150 (MQ=255) tGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTa > 1:1323345/1‑150 (MQ=255) aCCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAgg > 1:1373436/1‑62 (MQ=255) aCCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAgg < 2:1373436/62‑1 (MQ=255) cGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAg > 1:556776/1‑150 (MQ=255) atctaaCTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGtt < 1:1475396/146‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTggcg < 1:1005704/150‑1 (MQ=255) aagcgtgcatcactacccGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATACACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTggg < 1:557399‑M1/83‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTggcggc > 2:1493857/1‑150 (MQ=255) ggtGGATTTCGGGGGCCACCTGCTTTAACACCCGCAGGTTGCCCAGGTAGTAATGCATGCTTTCAGACAGGATCGCTATAAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGGAGGCCTGCCGGTATAACCGGGCGAGTAGGGAGTTGGAGGCGCAGa > 2:930798/3‑150 (MQ=255) tGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAgg < 2:1320862/45‑1 (MQ=255) tGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAgg > 1:1320862/1‑45 (MQ=255) tGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCGTCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAACCCGGCGAGACCGGGGTCGGCGGCGCatagt > 2:1666106/1‑146 (MQ=255) tttCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATcacca > 1:2204963/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATcaccac < 1:1493857/150‑1 (MQ=255) gcgGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGc > 1:939560/1‑66 (MQ=255) gcgGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGc < 2:939560/66‑1 (MQ=255) | GTGTTTCTGGCCATGGCTGCGCAGCAGGGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCAC > NC_002947/3359147‑3359440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |