| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4700790 = | 75 (0.850) | 5 (0.060) | 3/220 | NT | 6.1% | intergenic (‑57/+93) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C |
| ? | NC_002947 | 4700862 = | 87 (1.110) | intergenic (‑129/+21) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCAC > NC_002947/4700641‑4700939 | gCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGT > 1:1412467‑M1/1‑150 (MQ=255) cGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGT > 2:703434‑M1/1‑150 (MQ=255) cagctgccggtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGt > 2:1307137‑M1/148‑150 (MQ=255) ggggCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAG > 1:1641606‑M1/1‑150 (MQ=255) gctgccggtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAg > 1:1075167‑M1/146‑150 (MQ=255) gctgccggtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAg > 1:1859822‑M1/146‑150 (MQ=255) tgccggtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGa < 1:1712690‑M1/7‑1 (MQ=255) ccggtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGc > 2:728294‑M1/142‑150 (MQ=255) ggtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCgg > 1:308821‑M1/140‑150 (MQ=255) gtcgagcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccccccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCggg > 2:1471325‑M1/139‑150 (MQ=255) ccAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGT < 2:1405792‑M1/148‑1 (MQ=255) cAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:458369/1‑150 (MQ=255) agcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcattgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCGggttga < 1:103787‑M1/16‑3 (MQ=255) acacCTTCCGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCTCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTGTACGTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1656956/150‑1 (MQ=255) acacCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1972998/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACATCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAt > 2:546333/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:1500554/148‑1 (MQ=255) ttCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:1500554/1‑148 (MQ=255) ttCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGACACTCATGTTTCATCCTTTCCTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCATGCAAAGCCCCCATAATGTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAATa > 2:489720/1‑150 (MQ=255) cggccccggccGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTCACAAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGCGCGGATCTAGCCGCGAATACGTCAg > 1:632619/1‑150 (MQ=255) ccccggccGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACCCACGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTgg > 2:1363964/1‑150 (MQ=255) caggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTa < 1:1152389‑M1/4‑1 (MQ=255) caggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTa > 2:1152389‑M1/112‑115 (MQ=255) cggTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGcaccacc > 1:1663059/1‑150 (MQ=255) tGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCaccaccacc < 1:657018/150‑1 (MQ=255) cGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGc > 1:1278100/1‑150 (MQ=255) ggAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGG < 1:79640‑M1/111‑1 (MQ=255) ggAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGC < 1:1016214‑M1/108‑1 (MQ=255) ggAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGC > 2:1016214‑M1/1‑108 (MQ=255) ggTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGAGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGt > 2:2211151/1‑125 (MQ=255) gTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaatgcggttgtggtgccactgacgtattcgcgg < 1:969177‑M1/150‑42 (MQ=255) ttGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcg > 1:1282615‑M1/1‑108 (MQ=255) ttGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCggg < 2:1141360/150‑1 (MQ=255) cattgctcggcccgccggtcgtcaacgtgctggccttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtgaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGACTACGTTAGTGTCACGACCACGTCATTCGCgg > 2:859634‑M1/96‑150 (MQ=255) cattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagacTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCgg > 2:2207202‑M1/96‑150 (MQ=255) cattgaccggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCgg > 1:2047612‑M1/96‑150 (MQ=255) tGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGt < 1:219767/150‑1 (MQ=255) cAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGACCGCAGCAGGTCCGTGTATGAGCGGGGTTACCCGCGACTACGTCAGTGGCACTACCACTGCATTCGCGGGTGaac < 1:42582‑M2/150‑4 (MQ=255) aaCCGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTACTCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacc > 1:489720‑M2/1‑146 (MQ=255) aaCAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacc < 1:2015227‑M1/150‑49 (MQ=255) 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2:1544213/150‑1 (MQ=255) aGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATgg > 2:1717772/1‑126 (MQ=255) aGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCa > 1:2062848/1‑150 (MQ=255) gggAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCaa > 1:2101519/1‑150 (MQ=255) aaGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGcc > 1:1605817/1‑150 (MQ=255) gCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCCCGACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAg > 2:1152746/1‑150 (MQ=255) ccccTTAACGTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtatt < 1:1741906‑M1/60‑37 (MQ=255) ccTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTTCTTCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTTGTGCAACGCCCGCaag > 2:489857/1‑148 (MQ=38) cTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCaa > 1:1239694/1‑127 (MQ=255) tgtAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacatgagtgcctccgcctgcgcct > 2:133516‑M1/1‑14 (MQ=255) tgtAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcgg > 2:260769‑M1/1‑14 (MQ=255) TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGaccac < 1:994946‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCAC > NC_002947/4700641‑4700939 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |