| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 4793607 = | 105 (1.190) | 6 (0.070) | 6/232 | NT | 5.8% | coding (278/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | 4793634 = | 95 (1.150) | coding (251/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGAC > NC_002947/4793458‑4793755 | ttcgcgctgttgccgatcgcgcctggggtcgaggttgctgcccgtgacgcgctgtcatatgcccagcagcgcatgtggttcgcctggcggctcgatgccaagagtgctgcctacaacctgcccatggcagtcaagctcaaggggccgata > 2:764059‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcgcgctgttgccgatcgcgcctggggtcgaggttgctgcccgtgacgcgctgtcatatgcccagcagcgcatgtggttcgcctggcggctcgatgccaagagtgctgcctacaacctgcccatggcagtcaagctcaaggggccgata > 1:812706‑M1/150‑150 (MQ=255)ttcgcgctgttgccgatcgcgcctggggtcgaggttgctgcccgtgacgcgctgtcatatgcccagcagcgcatgtggttcgcctggcggctcgatgccaagagtgctgcctacaacctgcccatggcagtcaagctcaaggggccgata < 2:476624‑M1/1‑1 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gcCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCctgc > 2:641000/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCctgctg > 2:1146613/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCaa < 2:1890293/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAgg < 2:1730212/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGc > 1:2251097/1‑150 (MQ=255) 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2:257258/1‑148 (MQ=255) gcAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCat > 2:47497/1‑150 (MQ=255) gcAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCat > 1:1203154/1‑150 (MQ=255) aTTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACa < 1:47497/150‑1 (MQ=255) aTTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACa < 2:1104393/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCatat < 1:273125/142‑1 (MQ=255) tGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGcgcg > 2:1867853/1‑150 (MQ=255) tGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGcgcg > 2:1179446/1‑150 (MQ=255) gcgcCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGCGCTTGACTGCCATGGGAAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACAGGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCAc > 1:759863/1‑150 (MQ=255) gcgcCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTgg > 1:1049018/1‑131 (MQ=255) gcgcCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTgg < 2:1049018/131‑1 (MQ=255) gcgcCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCAc > 2:1598793/1‑150 (MQ=255) gcCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACgg > 1:174294/1‑150 (MQ=255) caccaGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAgg < 1:1450927/80‑1 (MQ=255) caccaGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAgg > 2:1450927/1‑80 (MQ=255) caaggggccgatAGCGCCTGAGGCCTTGCAGCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGgca < 2:431023‑M1/138‑1 (MQ=255) ccaGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACACGTGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGgcag < 1:1939003/150‑1 (MQ=255) caGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAg > 2:586925/1‑69 (MQ=255) caGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAg < 1:586925/69‑1 (MQ=255) tgtCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCt < 2:2035643/150‑1 (MQ=255) tgtCCAGCGCCTGCTGCAAGGACTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCCGCAACCt < 2:1203154/150‑1 (MQ=255) gtCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTc < 1:1827836/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGa > 2:314602/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGa > 1:1601529/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGa > 2:754914/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGAc > 1:74181/1‑150 (MQ=255) | CCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTCGTCAACCTCGGGAAACAGCGTGCGCAGCGATTCATGTCGCGCCACCAGGGTGTCCAGCGCCTGCTGCAAGGCCTCAGGCGCTATCGGCCCCTTGAGCTTGACTGCCATGGGCAGGTTGTAGGCAGCACTCTTGGCATCGAGCCGCCAGGCGAACCACATGCGCTGCTGGGCATATGACAGCGCGTCACGGGCAGCAACCTCGAC > NC_002947/4793458‑4793755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |