New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5238691 | 91 (1.030) | 7 (0.080) | 6/242 | NT | 7.3% | coding (155/204 nt) | PP_5701 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5238792 | 88 (1.020) | intergenic (+52/‑229) | PP_5701/PP_4616 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GGCGACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCA > NC_002947/5238543‑5238840 | ggCGACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAggg > 2:1838423/1‑150 (MQ=255) gACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGggccg > 1:324840/1‑150 (MQ=255) aCCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGAAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGggccgg > 1:306898/1‑150 (MQ=255) ccGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGggccggc < 2:402116/150‑1 (MQ=255) cGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGggccggcc < 2:1457556/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCctct > 1:1514826/1‑150 (MQ=255) gCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTTATCGCAGCACCTGCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTc < 2:81200/150‑1 (MQ=255) cGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATTCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTcgc > 2:709232/1‑150 (MQ=255) cGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTcgc > 2:2236837/1‑150 (MQ=255) cAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:2050515/150‑1 (MQ=255) cAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:584802/150‑1 (MQ=255) aTGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGgccggccctttcgcgggcacgcccgctcccac > 1:234902‑M1/1‑118 (MQ=255) aCGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCgg > 1:1860415/1‑150 (MQ=255) gATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTc < 1:1202545/150‑1 (MQ=255) aTGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcaccac > 2:1418727/1‑150 (MQ=255) aTGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcaccac > 2:1418691/1‑150 (MQ=255) tGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACcaca > 1:681806/1‑150 (MQ=255) tGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACcaca < 2:1860415/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcac > 1:1804540/1‑137 (MQ=255) ggCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTcac < 2:1804540/137‑1 (MQ=255) gcTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTc > 2:1280801/1‑105 (MQ=255) gcTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTc < 1:1280801/105‑1 (MQ=255) gcTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTAAAGCCt < 2:681806/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGcaca > 2:469797/1‑150 (MQ=255) tcttctTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGAGGTCGCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTa > 1:2259829/1‑150 (MQ=255) ttcttGAGTCGGCGCTGGTTCATGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTAcc > 2:1340032/1‑150 (MQ=255) ttcttGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTAcc > 2:146043/1‑150 (MQ=255) ttGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCtgt < 2:223943/150‑1 (MQ=255) gAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTgg < 2:1142122/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAg < 1:623079/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGc < 1:1886231/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTTCAGGTGCAGGTGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCg > 1:475772/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCg > 2:1519149/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCg > 2:1401504/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGgccggcctcttcgcgggctcgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgg < 2:324840‑M1/150‑80 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCAGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTCGGAGCgg > 2:1583630/1‑150 (MQ=255) cgcTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCggg < 1:1519149/150‑1 (MQ=255) gcTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTc < 1:1889195/108‑1 (MQ=255) gcTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTc > 2:1889195/1‑108 (MQ=255) gcTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCACACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTACCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCAAAGGACCTGGGGGAGCGGGc > 1:2229902/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGggccggcc > 2:197385/1‑75 (MQ=255) ttCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTTGTGTGGGGTTCACGACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGcc < 2:1153452/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagc > 2:27671‑M1/1‑63 (MQ=255) tCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagc < 1:27671‑M1/140‑78 (MQ=255) aGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 1:536197/1‑150 (MQ=255) cAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCACGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAg < 2:685935/150‑1 (MQ=255) aGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTcc < 1:133380/84‑1 (MQ=255) aGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTcc > 2:133380/1‑84 (MQ=255) aGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACATCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTGGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 1:450538/150‑1 (MQ=255) aGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGACCAGCCTCTTCGCGGACATGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg > 1:870965/1‑150 (MQ=38) gATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGgccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagagg < 2:234902‑M1/150‑97 (MQ=255) gATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGca < 2:1704848/115‑1 (MQ=255) gATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGca > 1:1704848/1‑115 (MQ=255) tGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc < 1:1340032/150‑1 (MQ=255) gTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGt > 1:2175413/1‑89 (MQ=255) gTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCg < 1:1838423/150‑1 (MQ=255) gTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCg < 2:2155587/150‑1 (MQ=255) tCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCATTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCgg < 2:2224031/150‑1 (MQ=255) tCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccgg < 1:1396315‑M1/150‑101 (MQ=255) tCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg > 1:831078/1‑145 (MQ=255) tCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 2:831078/145‑1 (MQ=255) tCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCgg > 1:1190221/1‑150 (MQ=255) cGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACag < 2:1226499/94‑1 (MQ=255) cGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACag > 1:1226499/1‑94 (MQ=255) cGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGAc < 2:2004390‑M2/150‑2 (MQ=255) cTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGAcct > 2:120751‑M2/1‑147 (MQ=255) gAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCAGTCACCACAGTAATCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGAGCGGGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGc < 1:1583630/150‑1 (MQ=255) cAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACa > 2:597782/1‑150 (MQ=255) aGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGa < 2:1735941/93‑1 (MQ=255) aGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGa > 1:1735941/1‑93 (MQ=255) aGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGAcct < 2:461336‑M2/142‑4 (MQ=255) ttCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATcc > 1:476287/1‑150 (MQ=255) ttCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATcc > 1:829727/1‑150 (MQ=255) gCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCg < 1:1273732/150‑1 (MQ=255) aCTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGa > 1:1356412/1‑82 (MQ=255) aCTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGa < 2:1356412/82‑1 (MQ=255) aCTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGc > 2:1787784/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACCGCGGTCACCACAGGAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCTCCGGCCATg > 1:1139749/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGAc < 2:2204304‑M2/125‑2 (MQ=255) aGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGAc > 1:2204304‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCATAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGc < 1:1134373/98‑1 (MQ=255) gCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCATAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGc > 2:1134373/1‑98 (MQ=255) gTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACagta < 1:1980372/65‑1 (MQ=255) gTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACagta > 2:1980372/1‑65 (MQ=255) ttAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGcc < 2:1313095/114‑1 (MQ=255) ttAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCg < 1:80154/115‑1 (MQ=255) ttAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCg > 2:80154/1‑115 (MQ=255) aaCGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCCTGCATTGAATAGTTCCTGTGGGACCGCTCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGc < 1:283891/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCa < 2:536197/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAg < 2:829727/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAgccgc > 2:1678757/1‑150 (MQ=255) ccGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAgccgc > 1:570452/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCa > 1:1197986/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCa > 1:2196284/1‑150 (MQ=255) aGGtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcctgggctcag > 2:120751‑M1/1‑3 (MQ=255) aGGtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcct > 1:461336‑M1/1‑3 (MQ=255) aGGtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcct < 2:461336‑M1/142‑140 (MQ=255) gtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagccttagtgcgaagttcctgggctcagcg < 2:2004390‑M1/150‑150 (MQ=255) gtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagcct > 1:2204304‑M1/1‑1 (MQ=255) gtccggccctttcgcgggcacgcccgctcccacaggtactgtgcaagtcttgactactgtggtgaccgctgtgggagcgggcgagcccgcgaagaggccggcccttccggcacgttaaccagcct < 2:2204304‑M1/125‑125 (MQ=255) | GGCGACCGATTGCCGCAAGGCACCTTGAGGCATGGCACGATGCATGAACTGGAGGCGCTGCGGCCTCTTCTTGAGTCGGCGCTGGTTCAGGTGCAGATGTCCGCTGAGCCCAGGAACTTCGCACTAAGGCTGGTTAACGTGCCGGAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGCGGTCACCACAGTAGTCAAGACTTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCGGACCTGCCGACAAATATCCCCGGCCATGCACCGTCGCAGCCGCCACCCCA > NC_002947/5238543‑5238840 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |