| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 5537105 | 72 (0.820) | 16 (0.230) | 11/194 | NT | 19.5% | intergenic (+34/+69) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
| ? | NC_002947 | = 5537127 | 76 (1.100) | intergenic (+56/+47) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGA‑CCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTC > NC_002947/5536958‑5537254 | gcgcAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAc < 2:2141757/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACTGGCGAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 1:122007/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCCAAGA‑CCAGCCCGTACGGGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGCGGCCTGCCGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGTGGGTGAAc > 2:80739/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcacc > 1:313318‑M1/1‑133 (MQ=255) ttCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCAcc > 1:2152122/1‑150 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcgctgggttcaccctcgt > 1:192655‑M1/1‑128 (MQ=255) cATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATacgagggtgggttcaccctcgta < 1:1297577‑M1/150‑24 (MQ=255) cATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCACGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCa < 1:1218539‑M2/150‑2 (MQ=255) aTGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcaccctcgtat < 2:313318‑M1/150‑25 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgc < 1:1202077‑M1/150‑29 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCATCTATCG‑AAAGACCCGGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCGCTTTGATAAGTGGCTTGCCGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGAGTGACCCCACCGACGCattcgcgg > 2:345625‑M2/1‑142 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgg > 2:88958‑M2/1‑142 (MQ=255) gTTGCCCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattggcgggtgaa > 2:1052147‑M2/1‑137 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAAcc < 2:2023045/128‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAAcc > 1:2023045/1‑128 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTCCCGTTCGCTCATTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaa > 1:163954‑M2/1‑137 (MQ=255) ccAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgc > 1:1292669‑M2/1‑132 (MQ=255) cAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGCACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgct < 1:1453943‑M2/150‑20 (MQ=255) gTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg > 2:71805/1‑107 (MQ=255) gTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 1:71805/107‑1 (MQ=255) gACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCCGGAGCGGGTTAACACGCGCCTACGAGCATGATCCCCGCGACGGACTTGCCGGGGAACGCGCTGCTGCAGGGTTc < 2:24638/150‑1 (MQ=255) catcatCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCTAACTGCCGTTCGCTCGAAGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGc < 1:1780074/150‑1 (MQ=255) atcatcGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgc > 2:1225340‑M1/1‑94 (MQ=255) catcGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGcc > 1:1150392/1‑148 (MQ=255) tcgtcgCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgc < 1:1480138‑M1/118‑29 (MQ=255) tcgtcgCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgc > 2:1480138‑M1/1‑90 (MQ=255) tcgtcgCAATCTAGCG‑CAAGAACCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATCAGTGGCCTGCAGGAGCTGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGTGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTGCGCCGTCa < 2:1004159/150‑1 (MQ=38) ccG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACt > 2:2206607/1‑150 (MQ=255) g‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgg < 1:1055093‑M2/105‑9 (MQ=255) aGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACg > 2:469911/1‑150 (MQ=255) aCCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGCGGGTGAACCCACCGATGCAGTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGAt < 1:2037188/150‑1 (MQ=255) 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> 1:1828026‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaagga < 1:1749568‑M2/71‑42 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaagga > 2:1749568‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATg > 1:1242393/1‑89 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATg < 2:1242393/89‑1 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGA‑CCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:1617942/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGACTTTGATTCCTTGACCCTGACCCTGGCCTTCGCTGAAGGGGA‑GTGGCCCGGGGAGGTGCAGGGGAAGGGGTAGTGgccacc > 2:509988/1‑150 (MQ=16) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgcgcttgtgctgggtcttgcggtaggtggcgacgatgat < 1:1225340‑M2/122‑95 (MQ=255) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgcgcttgtgctgggtcttgcggtaggtggcgacga < 1:1480138‑M2/118‑91 (MQ=255) gcgAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgcgcttgtgctgggtcttgcggtaggtggcgacga > 2:1480138‑M2/1‑28 (MQ=255) gAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGa < 1:774598/86‑1 (MQ=255) aTACGAGGGTGAACCCACCGACGCattcgcgggtgaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgcgcttgtgctgggtcttgcggtaggtggcgacgatgatgtcgaacgctgcctggtcaaccggctgcccat < 2:313318‑M2/150‑127 (MQ=255) tgcgtcggtgggttcaccctcgtattcgcgggtcaacccgctcctgcaggccacttatcaaggagcgaacggcagttcgtgcttgtgctgggtcttgcggtaggtggcgacgatgatgtcgaacgctgcctggtcaaccggctgcccatg < 1:1218539‑M1/150‑150 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGA‑CCTTGCCTTTCATCATCga > 1:1013430/1‑102 (MQ=255) tACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGA‑CCTTGCCTTTCATCATCga < 2:1013430/102‑1 (MQ=255) | GCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCG‑CAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGA‑CCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTC > NC_002947/5536958‑5537254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |