New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1480639 = | 86 (0.970) | 4 (0.050) | 4/236 | NT | 5.2% | coding (1106/1443 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
? | NC_002947 | 1480673 = | 65 (0.770) | coding (1072/1443 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
CCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGCCAC > NC_002947/1480525‑1480820 | ccATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCttt > 1:749556/1‑150 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtttt < 1:461639/149‑1 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtttt > 2:461639/1‑149 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTc < 2:1077939/150‑1 (MQ=255) atGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTTGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGAt < 1:1334865/150‑1 (MQ=255) atGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGAt > 2:2072622/1‑150 (MQ=255) tGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTcttgtatg > 2:1919423/1‑143 (MQ=255) aTCCCCCGCCCGGCCACGGCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCCCCCTTCGCCGGAGCTCTTCAGGGTCCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATgcgc < 1:1665016/150‑1 (MQ=255) cccGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTc < 1:1514572/150‑1 (MQ=255) aCGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTATCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTg > 1:1171455/1‑150 (MQ=255) cGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGc < 2:2054418/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCgg < 1:1974843/150‑1 (MQ=255) tacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTc > 1:1206879‑M1/83‑123 (MQ=255) tacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTc < 2:1206879‑M1/41‑1 (MQ=255) ggTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt < 1:1313927/150‑1 (MQ=255) gTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGAGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGCGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGAAGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGttt > 1:177786/1‑149 (MQ=255) tGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTgg < 2:794112/150‑1 (MQ=255) gACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt > 1:545179/1‑144 (MQ=255) gACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt < 2:545179/144‑1 (MQ=255) aCCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAac > 1:1474405/1‑150 (MQ=255) acacGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGATTTGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCa > 2:1374552/1‑150 (MQ=255) cacGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCAt > 2:1445823/1‑150 (MQ=255) cacGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCAt > 1:645362/1‑150 (MQ=255) ggTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCAc < 1:977459/150‑1 (MQ=255) agaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTc < 1:1100337‑M1/38‑1 (MQ=255) agaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTc > 2:1100337‑M1/67‑104 (MQ=255) tGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCAccc < 2:1924960/150‑1 (MQ=255) cgcCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTcc > 2:1320867/1‑150 (MQ=255) cgcCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTcc < 2:271191/150‑1 (MQ=255) cccTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCttt < 2:1335315/94‑1 (MQ=255) cccTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCttt > 1:1335315/1‑94 (MQ=255) ccTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCAc < 1:1988661/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACt > 2:1878818/1‑150 (MQ=255) ttCGCGTAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACtt > 1:1460718/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGTCGCAGCATGACCGGCGCGGACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACtt < 2:777669/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGc > 1:428280/1‑126 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGc < 2:428280/126‑1 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACtt > 2:2180131/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACtt > 1:98093/1‑150 (MQ=255) cgGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTc > 1:475912/1‑150 (MQ=255) ggAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCt < 2:1474405/150‑1 (MQ=255) gAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTg < 2:1171455/150‑1 (MQ=255) aaGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGCTACCCTCTCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTgg < 1:1694209/150‑1 (MQ=255) aaGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGGGCTgg < 1:1374552/150‑1 (MQ=255) tcCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCAcc > 2:1168415/1‑150 (MQ=255) ggTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGtt < 1:1501299/150‑1 (MQ=255) ttCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGt > 1:371372/1‑150 (MQ=255) tGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTTACCAGGTGGGacaaca < 2:98093/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGtt < 1:2180131/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGtt > 2:2335818/1‑150 (MQ=255) tttGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGttt < 2:645362/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTa < 1:1024122/150‑1 (MQ=255) 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aTTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGtgctg < 2:773158/150‑1 (MQ=255) gATACCGTCGCGTACCAGCGTTTCCTCGATGCGCCGGCCTTCGCCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTTACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTGGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTc < 2:177786/150‑1 (MQ=255) tACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCTTTGCGGTTGGCGAACACCATCTCCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTTACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCa < 1:1445823/150‑1 (MQ=255) gTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGt > 2:1617397/1‑150 (MQ=255) tCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGtt > 1:1090005/1‑150 (MQ=255) 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cagctTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGc > 2:1715982‑M2/6‑150 (MQ=255) cagctTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGc > 2:1319576‑M2/6‑150 (MQ=255) gctTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGCCa > 1:1009128‑M2/4‑150 (MQ=255) ctTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGCCAc > 1:1148665‑M2/3‑150 (MQ=255) | CCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGCCAC > NC_002947/1480525‑1480820 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |