New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4668931 | 92 (1.040) | 7 (0.080) | 6/238 | NT | 7.0% | coding (757/1533 nt) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
? | NC_002947 | = 4668953 | 97 (1.150) | coding (779/1533 nt) | nuoM | NADH‑quinone oxidoreductase subunit M |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCTTCCTGGCCTTC > NC_002947/4668805‑4669098 | gACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGAc > 2:1052512‑M2/1‑149 (MQ=255) gCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGc < 1:1842175/150‑1 (MQ=255) gCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGc < 2:2080159/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCCGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCg > 1:2229064/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCgg < 2:2056192/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGt > 1:1929081/1‑150 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc > 2:678394/1‑150 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc < 2:2105216/150‑1 (MQ=255) gCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTCGCTGCCTGACGCCCAGTCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATc > 1:2250702/1‑150 (MQ=255) ccGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCt > 1:2118830/1‑150 (MQ=255) gAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTg < 1:2235546/150‑1 (MQ=255) gAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATCCCGGGCATCACCAAGCCGGTCGCGTTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTg < 1:522235/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGGCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCt < 2:852173/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCt < 1:678394/150‑1 (MQ=255) gccggccgGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCCATCCTGGCTGCCTGACGCCTTCAACGTGGCAGCTAGCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGaa < 1:989797/150‑1 (MQ=255) ccggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAg > 2:2000624/1‑150 (MQ=255) ccggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAg < 1:1771717/150‑1 (MQ=255) cggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCTCGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGCAGa > 1:1788759/1‑150 (MQ=255) ggccggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGAcctggcgtgggcgtcaggcagcca > 2:2051679‑M2/1‑126 (MQ=255) ggTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCTCGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGCAGACagcg < 2:1788759/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGcc > 1:1352882/1‑150 (MQ=255) tCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCCGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTGTCTTGCTGAAGACCGCGGCCt > 2:1537179/1‑150 (MQ=255) cGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTa < 1:2277508/150‑1 (MQ=255) gAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTg < 1:861726/135‑1 (MQ=255) tACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGAc > 1:1109222‑M2/1‑113 (MQ=255) tACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGAc < 2:1109222‑M2/114‑2 (MQ=255) aCGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTAGTGCTGCGGCCATGGCTCGGCGGGTTTCTCTCCTGGCTGCCTGACGCGCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGcc < 1:2271486/150‑1 (MQ=255) tGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCctgc < 1:2000624/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCtgctgc > 1:1434480/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCtgctgc < 2:2229064/150‑1 (MQ=255) ttcttcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTg > 2:1707720/1‑150 (MQ=255) tcttcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCg > 2:875109/1‑144 (MQ=255) tcttcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCg < 1:875109/144‑1 (MQ=255) tcttcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGc < 1:2118906/150‑1 (MQ=255) tcttcATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGc < 1:1232160/150‑1 (MQ=255) cATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCt < 1:1630295/150‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGc > 1:2221578/1‑140 (MQ=255) aTCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGc < 2:2221578/140‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTg > 1:1177295/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACcgag > 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1:1586695‑M2/1‑27 (MQ=255) ccAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGAcctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagc < 2:1586695‑M2/107‑81 (MQ=255) ccAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt > 1:662632/1‑150 (MQ=255) ccAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt > 1:31613/1‑150 (MQ=255) ccAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt < 2:1177295/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTAtctt < 2:31613/150‑1 (MQ=255) ccAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTG‑ctgggcgtgagcgtcaggcagccaggagtggaacggcaccactggcagcttcaccgcgaaggcgatgaagaagcccagcatcagcacgtactcgataccggccggcaactcggccttgagcagg < 2:877139‑M2/150‑125 (MQ=255) gCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGc > 1:2201576/1‑132 (MQ=255) accgaccgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACgg > 2:1463539/1‑150 (MQ=255) ccgaccgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGc < 1:1557370/98‑1 (MQ=255) cgaccgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTg < 1:979892/150‑1 (MQ=255) cgaccgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTg > 1:474650/1‑150 (MQ=255) cgaccgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGACCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTg > 1:1000782/1‑150 (MQ=255) accgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGcc > 1:587884/1‑150 (MQ=255) ccgCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCt < 2:662632/150‑1 (MQ=255) aGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCTTCCt < 1:1478624/150‑1 (MQ=255) aGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCTTCCt < 2:690142/150‑1 (MQ=255) aGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCTTCCt < 2:1929081/150‑1 (MQ=255) gCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTgg > 2:2254238/1‑117 (MQ=255) gCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTgg < 1:2254238/117‑1 (MQ=255) gTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCTTCCTGGCCTTc > 2:1239429/1‑150 (MQ=255) | GACCTGCTCAAGGCCGAGTTGCCGGCCGGTATCGAGTACGTGCTGATGCTGGGCTTCTTCATCGCCTTCGCGGTGAAGCTGCCAGTGGTGCCGTTCCACTCCTGGCTGCCTGACGCTCACGCCCAGGCACCGACCGCAGGCTCGGTGGACCTGGCGGGTATCTTGCTGAAGACCGCGGCCTACGGCCTGCTGCGCTTCGCTCTGCCGCTGTTCCCGAACGCCTCGGCCGAGTTCGCGCCGATCGCCATGACCCTGGGCCTGATCGGTATCTTCTACGGTGCCTTCCTGGCCTTC > NC_002947/4668805‑4669098 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |