New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4925023 | 84 (0.950) | 12 (0.140) | 11/244 | NT | 12.7% | coding (72/855 nt) | PP_4334 | ParA family protein |
? | NC_002947 | 5222630 = | NA (NA) | coding (8/840 nt) | PP_4602 | AraC family transcriptional regulator |
TCGGCAGCAACAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAGGGATTAACGCCGAT > NC_002947/5222481‑5222759 | tCGGCAGCAACAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGCGACGGGGGTGGTCGAGGGACTGGTAGAGCGTTTCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCtt < 1:2272760/150‑1 (MQ=255) gcagcaACAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTa > 2:2158885/1‑150 (MQ=255) agcaACAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATc < 2:1450844/150‑1 (MQ=255) agcaACAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATc < 1:74473/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATcaaa > 2:589460/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATcaaa < 1:1448947/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTCCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATcaaa < 1:1219891/150‑1 (MQ=255) tACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAAGCCGCTTCTATCAAACAAAAGAt > 2:274710/1‑150 (MQ=255) tACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGAGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGAt > 1:470026/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGTGGGTGTCGGTCATCTGTTGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATaa < 1:731161/150‑1 (MQ=255) gCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCAc < 1:2098742/150‑1 (MQ=255) aGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttct > 2:589489/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttcttt > 2:1764742/1‑150 (MQ=255) gCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttctttc < 1:589489/150‑1 (MQ=255) gCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttctttc < 1:589460/150‑1 (MQ=255) gCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttctttc < 1:1975285/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTa < 1:49238/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTa > 2:787195/1‑150 (MQ=255) cTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGGCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTa < 2:413412/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTAt > 1:504571/1‑119 (MQ=255) tCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTAt < 2:504571/119‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACaaaa > 2:752734/1‑128 (MQ=255) tCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACaaaa < 1:752734/128‑1 (MQ=255) cGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGc > 2:1522686/1‑150 (MQ=255) gggTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGaa > 2:2098217/1‑150 (MQ=255) ggggcggTGCTGGTCGAGGGACTGGTATAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTTATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGaaaacgcct < 1:671843/150‑6 (MQ=255) gTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGgcgcg > 1:2182430/1‑150 (MQ=255) ggACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAAAAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATgg < 1:689323/150‑1 (MQ=255) aCTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATggcg < 1:1433233/150‑1 (MQ=255) tAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGaa > 1:1951501/1‑150 (MQ=255) tAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGaa < 1:1361001/150‑1 (MQ=255) gagGGTTGCCGGGGGGGTGTGCGTCATTTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAATCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTGCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAgt < 1:819647/150‑1 (MQ=18) gagGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAgt > 2:1743543/1‑150 (MQ=255) gagGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAgt < 1:787195/150‑1 (MQ=255) gagGGTTGCCAGGGGGGTGGCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAgt > 1:1832689/1‑150 (MQ=255) agGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAgtg < 1:361667/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttct < 1:1719953/103‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGtt > 2:690811/1‑150 (MQ=255) ggTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCGTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttct > 2:1719953/1‑103 (MQ=255) ttGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCTTCATCGACGGTGACCCCACTTCTATAAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCa < 1:274710/150‑1 (MQ=21) ttGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCa < 2:1352899/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGTCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCActc > 1:273393/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCActc < 1:2098217/150‑1 (MQ=255) cAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTAGCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCActct > 1:2199895/1‑150 (MQ=255) aGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACtctt < 1:690811/150‑1 (MQ=255) ggggggTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGTTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttctttc < 1:45728/98‑1 (MQ=255) ggggggTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGttctttc > 2:45728/1‑98 (MQ=255) gtgtCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATAc > 2:578159/1‑150 (MQ=255) tCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTg > 2:2009901/1‑150 (MQ=255) ggTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATc > 2:2315938/1‑61 (MQ=255) ggTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATc < 1:2315938/61‑1 (MQ=255) ggTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCGCTCTTCTATACGTGGt < 2:2182430/150‑1 (MQ=255) ggTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGt > 2:2213999/1‑150 (MQ=255) ggTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGt < 2:1126777/150‑1 (MQ=255) gTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAGAACAGTTTCGTGGCGTCAATGTCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTc < 1:2158885/150‑1 (MQ=17) gTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTc < 1:1522686/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCGGTTCTCTGATGGCCGGGCCCGCCTCGTCGTAGATGAAGCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTcaca < 2:1777244/150‑1 (MQ=14) gTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAAc > 1:1350022/1‑93 (MQ=255) gTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAAc < 2:1350022/93‑1 (MQ=255) tCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCGAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGaa > 1:136115/1‑118 (MQ=255) tCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCGAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGaa < 2:136115/118‑1 (MQ=255) tCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATACCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAgagat > 1:1777244/1‑146 (MQ=255) ggTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGTCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATgg < 2:1598953/109‑1 (MQ=255) ggTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGTCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATgg > 1:1598953/1‑109 (MQ=255) gTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCta < 2:290180/130‑1 (MQ=255) gTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCta > 1:290180/1‑130 (MQ=255) ctctGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATcaaa > 2:2162117/1‑49 (MQ=255) ctctGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATcaaa < 1:2162117/49‑1 (MQ=255) tggctggGTCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAg < 2:273393/150‑1 (MQ=38) tggctggGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAg < 1:1743543/150‑1 (MQ=40) gccggccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAGGGATTaa > 2:2197921/1‑150 (MQ=35) ccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATggcggc > 1:58220/1‑91 (MQ=34) ccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATggcggc < 2:58220/91‑1 (MQ=34) ccTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAGGGATTAACGCCg < 2:2199895/150‑1 (MQ=32) tctTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTg < 1:957829/113‑1 (MQ=31) tctTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTg > 2:957829/1‑113 (MQ=31) tctTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAGGGATTAACGCCGAt < 1:34277/150‑1 (MQ=31) | TCGGCAGCAACAGCGATACGCCGGCGAGCAGGGCCTCGAGGGTGGCGGGGCGGTGCTGGTCGAGGGACTGGTAGAGGGTTGCCAGGGGGGTGTCGGTCATCTGTCGGTTCTCTGCTGGCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTTCTATCAAACAAAAGATAACCCACTGTTCTTTCTAGCGAAAAAAACAGGCGCGCGGGGTCAATGGCGGCGAAGTGTTCACTCTTCTATACGTGGTCACAGCAAGCTGTGCCGACAGGGATTAACGCCGAT > NC_002947/5222481‑5222759 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |