New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5048151 = | 81 (0.920) | 6 (0.070) | 6/238 | NT | 7.6% | intergenic (‑173/+170) | PP_5685/PP_4451 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5048180 = | 68 (0.800) | intergenic (‑202/+141) | PP_5685/PP_4451 | hypothetical protein/hypothetical protein |
TATACGCATGTGACTGCTCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACAAATATTACCTG > NC_002947/5048033‑5048327 | ttttgaccgagttgtcaaggcacttcaaggtcaaatttcgccgggaaaatgttatcaaagattactcaggccgtcagagcaagcggagcgcgcatgcgggaggatggaagcccaacgggccaagacgggcgggcaccgtcaggcttggcc > 2:951090‑M2/149‑150 (MQ=255) gaccgagttgtcaaggcacttcaaggtcaaatttcgccgggaaaatgttatcaaagattactcaggccgtcagagcaagcggagcgcgcatgcgggaggatggaagcccaacgggccaagacgggcgggcaccgtcaggcttggCCCGtt < 1:951090‑M2/6‑1 (MQ=255) aTGTGACTGCTCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGc > 1:1414669/1‑150 (MQ=255) gtgACTGCTCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCtt > 1:1840223/1‑150 (MQ=255) gACTGCTCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAACCCCTCTTTCGGGAGCTGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTcc < 2:1592128/150‑1 (MQ=255) gCTCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCAtcc > 1:1270090/1‑150 (MQ=255) aaggcacttcaaggtcaaatttcgccgggaaaatgttatcaaagattactcaggccgtcagagcaagcggagcgcgcattcgggaggatggaagcccaacggaCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGtt < 2:1538529‑M1/35‑1 (MQ=255) aaggcacttcaaggtcaaatttcgccgggaaaatgttatcaaagattactcaggccgtcagagcaagcggagcgcgcattcgggaggatggaagcccaacggaCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGtt > 1:1538529‑M1/104‑138 (MQ=255) tCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCAtcctc > 2:1183809/1‑150 (MQ=255) aTTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTccc < 2:2021692/150‑1 (MQ=255) cacttcaaggtcaaatttcgccgggaaaatgttatcaaagattactcaggccgtcagagcaagcggagcgcgcatgcgggaggatggaagcccaacgggccaagcctgacggtgcccgcccgtcttggCCCGTTGGGCTTCCATCCTccc < 2:2287873‑M2/22‑1 (MQ=255) tCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCAt < 2:1711638/150‑1 (MQ=255) tCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCAt > 1:548332/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCAt < 2:548332/150‑1 (MQ=255) tCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCAt > 1:1711638/1‑150 (MQ=255) aGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATgcg > 2:1231929/1‑150 (MQ=255) gTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATgcgc < 1:2159809/150‑1 (MQ=255) tCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGTGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATgcgcg > 2:507721/1‑150 (MQ=255) gTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTccc < 1:1862999/139‑1 (MQ=255) gTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTccc > 2:1862999/1‑139 (MQ=255) gACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCGGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCtt > 2:211990/1‑150 (MQ=255) gACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCtt > 1:1388974/1‑150 (MQ=255) aCAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTg < 1:189928/150‑1 (MQ=255) gTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTg > 2:1325816/1‑150 (MQ=255) cGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGAc < 2:1041058/150‑1 (MQ=255) gCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCAt > 2:1263554/1‑118 (MQ=255) gCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCAt < 1:1263554/118‑1 (MQ=255) tACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGc < 1:1183809/150‑1 (MQ=255) cTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCt < 2:1598300/150‑1 (MQ=255) cTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCt < 1:605859/150‑1 (MQ=255) tCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTg > 2:2317830/1‑150 (MQ=255) tCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTg > 2:1973906/1‑150 (MQ=255) tCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTg > 1:1853011/1‑150 (MQ=255) cAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGa < 1:2014214/150‑1 (MQ=255) cAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGa < 1:657949/150‑1 (MQ=255) aaaCCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCt < 1:692480/147‑1 (MQ=255) aaaCCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCt > 2:692480/1‑147 (MQ=255) aaCCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGt > 2:2081990/1‑150 (MQ=255) aaCCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCATGAGt < 2:32578/150‑1 (MQ=255) aCCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTa < 2:706584/150‑1 (MQ=255) ccTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTaa > 2:917606/1‑150 (MQ=255) aCTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCtt < 2:1840223/150‑1 (MQ=255) tATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTg < 1:1325816/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑ttt > 2:1889877/1‑150 (MQ=255) tGAGTCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAATCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTcc < 2:310533/150‑1 (MQ=255) ccAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGc > 1:949866/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAAttt < 2:1414669/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAAttt > 2:1178664/1‑150 (MQ=255) gCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGTTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGa < 2:1124149/150‑1 (MQ=255) cACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGaa > 2:1896720/1‑150 (MQ=255) aCTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAg < 1:507721/150‑1 (MQ=255) gggaggatggaagcccaacgggCCAAGACGGGCGG‑GCACCGTCAGGCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTg < 2:2287873‑M1/128‑1 (MQ=255) tGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCtt < 2:444595/150‑1 (MQ=255) gCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGa < 2:1270090/150‑1 (MQ=255) gAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGaa < 2:311693/139‑1 (MQ=255) gAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGaa > 1:311693/1‑139 (MQ=255) gAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACa > 1:1385050/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAAc < 1:2317830/150‑1 (MQ=255) tGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACATTTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGt > 2:1581076/1‑137 (MQ=255) tGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACATTTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGt < 1:1581076/137‑1 (MQ=255) tGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTTACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCg < 1:1231929/150‑1 (MQ=255) tGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCg < 1:1973906/150‑1 (MQ=255) tCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGt > 1:1076747/1‑150 (MQ=255) tCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGt > 1:1207235/1‑150 (MQ=255) cGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTc < 2:1385050/150‑1 (MQ=255) aacgggCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTc < 1:951090‑M1/144‑1 (MQ=255) aacgggccaagacgggcgggcaccgtcaggcttggTCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGAATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCtt < 2:1538529‑M2/103‑1 (MQ=255) aacgggccaagacgggcgggcaccgtcaggcttggTCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGAATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCtt > 1:1538529‑M2/36‑138 (MQ=255) ggCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCaaaa > 2:951090‑M1/3‑150 (MQ=255) aCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGaa > 1:241536/1‑126 (MQ=255) aCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGaa < 2:241536/126‑1 (MQ=255) aCCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAg > 2:395156/1‑150 (MQ=255) CAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCtt > 1:1809020‑M1/1‑131 (MQ=255) CAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCtt < 2:1809020‑M1/131‑1 (MQ=255) CAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGtt < 1:5041‑M1/150‑1 (MQ=255) aagacgggcgggcaccgtcaggcttggCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGc > 1:1188935‑M2/28‑64 (MQ=255) aagacgggcgggcaccgtcaggcttggCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGc < 2:1188935‑M2/37‑1 (MQ=255) gACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCtttt > 2:999086/1‑150 (MQ=255) aCGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCttttt < 2:5041/150‑1 (MQ=255) cGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCtttttt < 2:1388974/150‑1 (MQ=255) ggTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTc < 2:1076747/150‑1 (MQ=255) c‑ccgcccgTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGcac > 2:2087667/1‑150 (MQ=255) gcccgTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACaaa > 2:1142643/1‑150 (MQ=255) ccgTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGCCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACAAata < 1:112644/150‑1 (MQ=255) tggCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACAAATATTACCt < 1:2081990‑M2/147‑1 (MQ=255) ggCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACAAATATTACCTg < 1:999086‑M2/148‑1 (MQ=255) ggCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACAAATATTACCTg < 1:1142643‑M2/148‑1 (MQ=255) | TATACGCATGTGACTGCTCATTTTCCAGTCGTGAACGACAAGGTCGCTACTCAAACCTAACTATGGGAGCGGTTGAGCCAGGAGGTGCGGGGCCACTCCGTGGCGAGGCTGTCGTAAACCAAGCCTGACGGTGC‑CCGCCCGTCTTGGCCCGTTGGGCTTCCATCCTCCCGCATGCGCGCTCCGCTTGCTCTGACGGCCTGAGTAATCTTTGATAACA‑TTTTCCCGGCGAAATTTGACCTTGAAGTGCCTTGACAACTCGGTCAAAAGTTACCTTTTTTCGCACAAATATTACCTG > NC_002947/5048033‑5048327 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |