New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5350520 = | 76 (0.860) | 8 (0.090) | 5/240 | NT | 9.2% | intergenic (+9/+73) | PP_4704/PP_4705 | hypothetical protein/glyoxalase |
? | NC_002947 | 5350571 = | 84 (0.980) | intergenic (+60/+22) | PP_4704/PP_4705 | hypothetical protein/glyoxalase |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GACCGGGTGTACTTCATCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCGAGCAAGGTCACG > NC_002947/5350425‑5350719 | gacCGGGTGTACTTCATCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 1:1153176/1‑150 (MQ=255) gggttgaCTGCAGCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 2:1551564/144‑1 (MQ=255) tggacccggccgggaacaaggttcaaccgctgtatcacccggcggtgtcggggcagcggttggtttgaagcccgtgctggcctcttcgcgggcaggcccgcccccacaggcctgcgcactacctgtgggagcgggcgtgccCGCGAagag < 2:449410‑M2/9‑1 (MQ=255) tgtACTTCATCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGc < 2:2022404/150‑1 (MQ=255) tgtACTTCATCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGc > 1:1243911/1‑150 (MQ=255) tCATCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCAc < 2:801298/150‑1 (MQ=255) tccaaGCCTGGGGCAGCATCAACGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTc < 1:1863712/146‑1 (MQ=255) aGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTTGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAaac < 1:2172359/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAaac < 2:104184/150‑1 (MQ=255) cTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCa < 1:1772089/132‑1 (MQ=255) cTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCa > 2:1772089/1‑132 (MQ=255) ccgctgtatcacccggcggtgtcggggcagcggttggtttgaagcccgtgctggcctcttcgcgGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAaga > 1:246566‑M1/65‑123 (MQ=255) ccgctgtatcacccggcggtgtcggggcagcggttggtttgaagcccgtgctggcctcttcgcgGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 2:246566‑M1/59‑1 (MQ=255) aGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGc > 1:2306977/1‑150 (MQ=255) ccTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGc < 2:20075/131‑1 (MQ=255) ccTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGc > 1:20075/1‑131 (MQ=255) cTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGcccc < 1:498515/150‑1 (MQ=255) tCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGccc < 2:1987900/109‑1 (MQ=255) tCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGccc > 1:1987900/1‑109 (MQ=255) cccggcggtgtcggggcagcggttggtttgaagcccgtgctggcctcttcgcgGGCACGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAagag < 2:192268‑M1/60‑1 (MQ=255) 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cTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGaa < 1:1892496/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCa > 2:2089012/1‑138 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCa < 1:2089012/138‑1 (MQ=255) gtgGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCg < 2:804033/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGTGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCg > 1:959170/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCg > 1:76591/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCGAGCAAg > 2:686078/1‑150 (MQ=255) gTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCGAGCAAGGt < 2:1906944/150‑1 (MQ=255) ccCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCCTGGTTGCACGGCCGGTTGAGCAAGGTGAc > 1:146180‑M2/3‑150 (MQ=255) cCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCGAGCAAGGTCACg > 2:1362128‑M2/2‑150 (MQ=255) | GACCGGGTGTACTTCATCGATACCAGCCTGGGGCAGCCTCAAAGCGATGGCCGGGTGGTGACACCGATGCACCTGGATGCCGAGTAATCCCCTCTGGCAGGCCCGCCCCCACAGGCC‑TGCGCACTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGCACGGGCTTCAAACCAACCGCTGCCCCGACACCGCCGGGTGATACAGCGGTTGAACCTTGTTCCCGGCCGGGTCCAGCAGGTGGAAGCTGCGTGCGCCGTCACCATGGTTGAACGGCCGGTCGAGCAAGGTCACG > NC_002947/5350425‑5350719 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |