Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,237,663 | A→G | 7.3% | L151P (CTG→CCG) | PP_1078 ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,237,663 | 0 | A | G | 7.3% | 222.7 / 7.0 | 83 | L151P (CTG→CCG) | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/38); new base G (3/3); total (42/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.13e-01 |
AGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAA > NC_002947/1237514‑1237807 | aGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCa > 1:167065/1‑150 (MQ=255) tcttcCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGcc < 2:878454/150‑1 (MQ=255) ttgcTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCg > 1:2332918/4‑150 (MQ=255) tcCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCgg < 1:570132/150‑1 (MQ=255) tcCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCgg < 1:1790530/150‑1 (MQ=255) cTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGc < 1:2300900/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGTAGCAGTTGCGGCTCGGGGGCCAGGGGCCGGGCCAg > 1:977023/1‑150 (MQ=255) gTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAg < 2:751933/150‑1 (MQ=255) gggTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGa < 1:1525876/150‑1 (MQ=255) tGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGacac > 1:1662635/1‑150 (MQ=255) tGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGacac < 2:185189/150‑1 (MQ=255) ccAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCACCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGtt > 2:1707753/1‑150 (MQ=255) cAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGTCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtg < 1:754203/150‑1 (MQ=255) cAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCTAGGGCGACACGTtg > 1:904333/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgctgc < 2:1010452/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTgg > 2:992241/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTgg < 1:992241/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgc < 2:2072927/150‑1 (MQ=255) gcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc > 2:130343/1‑150 (MQ=255) gcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc > 2:869621/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAggg < 2:1851670/125‑1 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAggg > 1:1851670/1‑125 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGa < 2:167065/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc < 2:1594683/142‑1 (MQ=255) cgcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc > 1:1594683/1‑142 (MQ=255) tttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGGCGGACAGCTCATg > 1:1982401/1‑150 (MQ=255) ttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGc < 1:130343/150‑1 (MQ=255) ttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGc > 1:706925/1‑150 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCGACGGCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCgg < 2:822113/150‑1 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCa > 2:480378/1‑97 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCa < 1:480378/97‑1 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCggg > 1:708275/1‑150 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAc < 2:2332918/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAc > 1:1396481/1‑150 (MQ=255) cgcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcc > 2:1754508/1‑150 (MQ=255) gcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAcgccc < 2:1507350/150‑1 (MQ=255) gAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGGCGAGGTTGGAGAATGGCTCGGCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCCGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcccgc > 1:494181/1‑150 (MQ=255) cTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAg > 1:1732089/1‑150 (MQ=255) aTGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGccc > 2:1865484/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGAATGGAGAATGGGTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGa > 1:2200526/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGt < 1:1503297/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGtt < 2:706925/150‑1 (MQ=255) gcCGGCGCAGCGCCCCGTCGGGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCGGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGa < 2:494181/150‑1 (MQ=255) gcAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCt > 2:795409/1‑150 (MQ=255) cTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAg < 1:159478/150‑1 (MQ=255) tCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGTACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGc > 2:744732/1‑150 (MQ=255) cACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCGGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCAt > 1:1670941/1‑104 (MQ=255) cACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCGGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCAt < 2:1670941/104‑1 (MQ=255) aCGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGc < 2:350391/99‑1 (MQ=255) aCGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGc > 1:350391/1‑99 (MQ=255) cGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCACCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCAtct < 1:1707753/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCTAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATTCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTc < 2:904333/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTc > 2:969763/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTc > 2:1500473/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTc < 1:650091/150‑1 (MQ=255) tGGAGAATGGCTCGTCACCCAGCAGCAGTTGCGACTCGGGCTCCCGCGCCCGCGGCAGGGCCACACGTTGCTGCTCGCCGCCGGCCACCTCATGCGGGTACCGCCCGCCCAGCCCGCCGGGGTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATgg > 2:804603/1‑149 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAc > 2:802474/1‑99 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAAc < 1:802474/99‑1 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGa > 1:980854/1‑147 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGa < 2:980854/147‑1 (MQ=255) gaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGGACCCGCATCTTCTCTATGACGgc > 2:724711/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTAGCGGGTCGGGCGCCAGCGCCCGGGACAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCGCGCCCAGCCCGCCGAGATTGACCAGCTCCAACATCTCTTCGAGGACCgcc > 1:654258/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgccgc > 1:881394/1‑150 (MQ=255) gCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGTGCCAGCGCCCGGGCCAGGGTTACACGTTGCTGCTCGCCGCCGCACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCt < 2:1289514/150‑1 (MQ=255) cTCGTCAAGCAGCAGCATTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGTGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACG‑CCACCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCCgg < 2:977023/150‑1 (MQ=255) tCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGATAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCATCCTGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTgg > 1:524695/1‑150 (MQ=255) tCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTgg > 1:702576/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg < 1:2264778/150‑1 (MQ=255) aaGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg > 1:925688/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg < 2:1396481/150‑1 (MQ=255) agcagcagcAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc < 1:1793167/62‑1 (MQ=255) agcagcagcAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc > 2:1793167/1‑62 (MQ=255) gcagcagcaGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGgt < 2:708275/150‑1 (MQ=255) gcagcagcaGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGgt < 1:795409/150‑1 (MQ=255) gcagcagcaGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGgt > 2:1428737/1‑150 (MQ=255) cagcagTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg < 2:498883/144‑1 (MQ=255) cagcagTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg > 1:498883/1‑144 (MQ=255) gcagTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGCGTGTTTgg < 1:969763/150‑1 (MQ=255) gcagTTGCGACTCGGGCGACAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTgg > 2:513872/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGa > 1:810071/1‑150 (MQ=255) cctggcccGGGCGCTGGCGCCCGAGCCGGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGtt > 2:1130668/8‑142 (MQ=255) cctggcccGGGCGCTGGCGCCCGAGCCGGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGtt < 1:1130668/135‑1 (MQ=255) gCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGc > 1:457385/1‑145 (MQ=255) gCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGc < 2:457385/145‑1 (MQ=255) ccGGGCGCTGGCGCCCAGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAg > 2:1392767/2‑150 (MQ=255) gcgcCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCaa < 1:604853/150‑1 (MQ=255) | AGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAA > NC_002947/1237514‑1237807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |