Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,383,260 | A→T | 6.0% | L16Q (CTG→CAG) | PP_1204 ← | lipoprotein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,383,260 | 0 | A | T | 6.0% | 304.0 / 9.4 | 100 | L16Q (CTG→CAG) | PP_1204 | lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/51); new base T (3/3); total (46/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.94e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CACGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTCCA > NC_002947/1383114‑1383409 | cacGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTg < 2:2276454/150‑1 (MQ=255) acGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTACTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgc < 1:709749/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcggcg < 1:783602/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGgcgc > 2:1837810/1‑150 (MQ=255) gAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcggc > 1:1398675/1‑142 (MQ=255) gAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcggc < 2:1398675/142‑1 (MQ=255) gAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCaa < 2:1772809/150‑1 (MQ=255) gAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCaa < 1:1925602/150‑1 (MQ=255) cTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGt > 1:957503/1‑150 (MQ=255) tCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTa > 2:1312832/1‑150 (MQ=255) cATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTTGGACATCTGGTTGGCGCAGCAGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTaaa > 1:726100/1‑150 (MQ=255) cATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTaaa > 2:528224/1‑150 (MQ=255) aTCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAg < 2:1521942/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCGGCTCACCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACATTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAgg < 2:1645063/150‑1 (MQ=255) cACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGt < 2:2101316/150‑1 (MQ=255) cACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGt < 2:44718/150‑1 (MQ=255) ccTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTAc > 1:308150/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTAc < 2:464143/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcggcg > 1:71082/1‑130 (MQ=255) cTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcggcg < 2:71082/130‑1 (MQ=255) cTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAg > 2:1328527/1‑145 (MQ=255) cTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAg < 1:1328527/145‑1 (MQ=255) gCTCGCCGACATCGATCTGCATGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTaa < 1:600362/138‑1 (MQ=255) gCTCGCCGACATCGATCTGCATGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTaa > 2:600362/1‑138 (MQ=255) 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aTCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCTCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAgg < 1:2290758/124‑1 (MQ=255) aTCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCTCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAgg > 2:2290758/1‑124 (MQ=255) cGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCa < 2:1711519/150‑1 (MQ=255) gATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCAc > 2:1951371/1‑150 (MQ=255) aTCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACt > 2:1233102/1‑150 (MQ=255) tCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTGCGGCGccct > 2:1087411/1‑113 (MQ=255) tCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTGCGGCGccct < 1:1087411/114‑2 (MQ=255) gCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGcccc > 2:1017544/1‑111 (MQ=255) gCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGcccc < 1:1017544/111‑1 (MQ=255) cAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCCTGTTATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGc > 1:187476/1‑150 (MQ=255) ggTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGa < 1:646484/137‑1 (MQ=255) ggTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACCTCGCTTGTACATGa > 2:646484/1‑137 (MQ=255) 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gTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAgcggcg > 2:831600/1‑150 (MQ=255) tttGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGcccc > 2:746846/1‑92 (MQ=255) tttGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGcccc < 1:746846/92‑1 (MQ=255) cgcTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAAcgc < 2:1642914/150‑1 (MQ=255) cTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCgg < 2:278968/150‑1 (MQ=255) cTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCgg < 1:1659357/150‑1 (MQ=255) 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gACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGcc > 1:226096/1‑150 (MQ=255) aagcgcTCCTCCGGGTCGCTGCGCTTGGACCTCTAGTTCGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCt < 2:957503/148‑1 (MQ=255) gcgcTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCGGGGCGCCGCACTGTGCGGCGccctg > 2:1169190/1‑79 (MQ=38) gcgcTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCGGGGCGCCGCACTGTGCGGCGccctg < 1:1169190/81‑3 (MQ=38) cgcTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCa < 2:1123754/150‑1 (MQ=255) gcTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAg < 1:192200/150‑1 (MQ=255) 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tGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGTGTAAAGGTACTTTGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTc > 1:2111931/1‑150 (MQ=255) taCGAGCAGGTCGCCGCACAGTGCGGCGGACACAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcg < 2:2134765/149‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCGAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCgg > 2:1437757/1‑95 (MQ=255) aCGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCgg < 1:1437757/95‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcggt < 1:1340294/150‑1 (MQ=255) aGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTgg < 1:353703/131‑1 (MQ=255) aGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTgg > 2:353703/1‑131 (MQ=255) ggCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCggtgcggtgc > 2:698603/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCACTGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAg < 1:948194/103‑1 (MQ=255) gcgcCGCACTGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAg > 2:948194/1‑103 (MQ=255) gcgcCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCAGTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCt > 2:1680123/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCt < 1:2023481/150‑1 (MQ=255) cgccgcACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCtt < 1:1084784/150‑1 (MQ=255) gccgcACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTg < 1:698603/150‑1 (MQ=255) gcACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTa > 1:2052895/1‑149 (MQ=255) gcACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTa < 2:2052895/149‑1 (MQ=255) acaGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTg < 2:2256741/145‑1 (MQ=255) acaGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTg > 1:2256741/1‑145 (MQ=255) aGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTCCa > 1:176559/1‑150 (MQ=255) aGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTCCa < 1:1124214/150‑1 (MQ=255) | CACGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGCGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTCCA > NC_002947/1383114‑1383409 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |