Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,897,245 | G→T | 11.5% | intergenic (‑56/+88) | PP_mr24 ← / ← rdgC | mini‑ykkC regulatory region/recombination‑associated protein RdgC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,897,245 | 0 | G | T | 11.5% | 313.2 / 20.2 | 103 | intergenic (‑56/+88) | PP_mr24/rdgC | mini‑ykkC regulatory region/recombination‑associated protein RdgC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/46); new base T (6/6); total (50/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCG > NC_002947/1897100‑1897393 | ggATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGtt < 1:969909/150‑1 (MQ=255) gatgatCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTa > 1:1224660/1‑150 (MQ=255) atCCAGGACATGAGTGTGTCGCCTTCGTTTGAATGGTGGTGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGATGGCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCAc < 2:432716/150‑1 (MQ=255) cAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTg > 1:191691/1‑150 (MQ=255) aGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGc > 2:617801/1‑150 (MQ=255) ggACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCa < 2:191691/150‑1 (MQ=255) cATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGgc < 1:617801/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCAGgcgc < 1:2033244/150‑1 (MQ=255) gtCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTa > 1:966783/1‑150 (MQ=255) ccATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcg > 1:1098926/1‑150 (MQ=255) cATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAgggg > 2:567181/1‑121 (MQ=255) aTCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTAGAACTTGGAGGCGGGGGAGTAcctact > 2:1301559/1‑146 (MQ=255) gTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAGGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcgcgc < 1:517410/148‑2 (MQ=255) gTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAGGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcgcgc > 2:517410/1‑147 (MQ=255) gTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAag > 1:215090/1‑150 (MQ=255) gAATGGTGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCAAGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc < 2:1655891/150‑1 (MQ=255) atgatgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 2:1129841/150‑1 (MQ=255) tgatgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTTCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGgcgc < 2:1243695/127‑1 (MQ=255) tgatgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTTCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGgcgc > 1:1243695/1‑127 (MQ=255) tgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTAc < 2:1225865/132‑1 (MQ=255) tgGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTAc > 1:1225865/1‑132 (MQ=255) gAGTGGTCACGCGGGGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAt < 1:1301559/150‑1 (MQ=255) aGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt < 2:1163599/150‑1 (MQ=255) aGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt < 2:2237380/150‑1 (MQ=255) tGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCa < 2:1175649/150‑1 (MQ=255) gTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAgg > 2:1452449/1‑150 (MQ=255) gTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAgg > 2:2212152/1‑150 (MQ=255) gTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAgg > 2:2061197/1‑150 (MQ=255) tCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAAcccc < 2:2175724/94‑3 (MQ=255) tCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAAcccc > 1:2175724/1‑92 (MQ=255) tCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCa < 2:1339565/99‑1 (MQ=39) tCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCa > 1:1339565/1‑99 (MQ=255) tCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCa < 2:2026105/135‑1 (MQ=255) tCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCa > 1:2026105/1‑135 (MQ=255) aCGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt < 2:69751/143‑1 (MQ=255) aCGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGAtt > 1:69751/1‑143 (MQ=255) ggTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCAc < 2:1991426/150‑1 (MQ=255) gAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGTCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCa < 1:2134900/150‑1 (MQ=255) ggTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGAACCTGCATTTCATa < 1:1585159/150‑1 (MQ=255) gtcgtcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATAc < 1:89522/150‑1 (MQ=255) gtcgtcCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAGCTGGCAGAAAACCATACAAGCCAGCACCTGCATTTCATAc > 2:2253885/1‑150 (MQ=255) 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tCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAg > 1:904544/1‑150 (MQ=255) tCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAg > 1:1099614/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcgc > 2:2253003/1‑88 (MQ=255) aCCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCcgc < 1:2253003/88‑1 (MQ=255) aCCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGAc > 2:496034/1‑150 (MQ=255) ccGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCAg < 2:1495286/71‑1 (MQ=25) ccGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCAg > 1:1495286/1‑71 (MQ=25) 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cATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGaa > 1:2057928/1‑150 (MQ=255) aTGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAAt < 2:2161233/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAAt < 2:1099614/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAAt < 1:2061197/150‑1 (MQ=255) tGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAAtc > 1:1150104/1‑150 (MQ=255) 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cTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTca < 1:2245346/150‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGtt < 2:1930378/55‑1 (MQ=255) cGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGtt > 1:1930378/1‑55 (MQ=255) gCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAgc < 1:1800494/150‑1 (MQ=255) gggCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGa < 2:1959367/150‑1 (MQ=255) ggCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCTCCCCGCGCCTCTaa < 2:89428/150‑1 (MQ=255) ggCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGaa < 1:200752/150‑1 (MQ=255) ggCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGaa < 1:128037/150‑1 (MQ=255) aaGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATa < 1:1972598/101‑1 (MQ=255) aaGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATa > 2:1972598/1‑101 (MQ=255) ccGCGCCTGCAAGTGGTAACCCCTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCAcc > 1:789871/1‑150 (MQ=255) cTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTcac > 1:1399958/1‑121 (MQ=255) cAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGc < 1:1704588/70‑1 (MQ=255) cAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGc > 2:1704588/1‑70 (MQ=255) aaGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGAACCGGCAGGAAtt > 1:1526057/1‑150 (MQ=255) | GGATGATCCAGGACATGAGTGTGTCTCCATCGTTTGAATGATGGGGCCGTCCCCGGAGTGGTCACGCGGTGCGTCGTGAGGTCGTCCTCACCGTGGGCACCATGGTGCCTGTCTGCGGCCTTGCGGGCAAGACCGCGCCTGCAAGGGGTTACCACTTGCAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTGCTGGCAGAAAACGATTCAGGCCAGCACCTGCATTTCATACCAATCAGACCCCTTGCGGAATCTCTTCACCACCCAGCGCCTCGAACAGCACCGGCAGGAATTCG > NC_002947/1897100‑1897393 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |