| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,062,881 | G→C | 5.5% | A585P (GCT→CCT) | PP_1838 → | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,062,881 | 0 | G | C | 5.5% | 227.0 / 2.4 | 72 | A585P (GCT→CCT) | PP_1838 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/33); new base C (2/2); total (37/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
AGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGCCC > NC_002947/2062732‑2063026 | agcagGTGACCGAGCTGCACCTCGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTTATTTCCCCGTGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAAGCACACCCTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGATCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAgg < 2:1070000/150‑1 (MQ=255) gcagGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGTAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGc > 1:795868/1‑150 (MQ=255) gcagGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGc > 1:537398/1‑150 (MQ=255) agGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGTCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTc < 1:524710/150‑1 (MQ=255) agGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTc < 1:84365/150‑1 (MQ=255) agGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTc < 2:1712627/150‑1 (MQ=255) aCCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccac > 2:690766/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccacca > 1:309864/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccacca > 1:2043434/1‑150 (MQ=255) ggACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTg > 1:2154309/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTgg > 1:1306863/1‑150 (MQ=255) gACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTgg > 1:1440383/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTgggg < 2:246608/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTggggg > 2:1357312/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCCCCAGCACTGGTGgcgc < 2:976372/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGcgcg < 2:1306863/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGcgcg > 2:1386657/1‑150 (MQ=255) gCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGAcc > 2:1039330/1‑150 (MQ=255) cTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCt < 1:641590/150‑1 (MQ=255) tCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGgcgc < 1:1621798/143‑1 (MQ=255) tCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGgcgc > 2:1621798/1‑143 (MQ=255) aaCGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTc < 2:1235333/150‑1 (MQ=255) aaCGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTc > 1:324358/1‑150 (MQ=255) aaCGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTc > 2:445145/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCaa < 2:2043434/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAAc < 1:1357312/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAAc > 1:1971740/1‑150 (MQ=255) ctgctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATTACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAg < 1:1271315/150‑1 (MQ=255) tgctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAgg < 1:445145/150‑1 (MQ=255) tgctgATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAgg < 1:1386657/150‑1 (MQ=255) gATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGa < 1:841354/150‑1 (MQ=255) gATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGa > 1:2083036/1‑150 (MQ=255) ccccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCggg < 1:2332905/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGc > 2:784896/1‑150 (MQ=255) cGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccac < 1:413717/101‑1 (MQ=255) cGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGccac > 2:413717/1‑101 (MQ=255) ggCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTa > 1:1631457/1‑150 (MQ=255) ggAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGAt > 1:2095511/1‑150 (MQ=255) gTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGcc < 1:1626794/150‑1 (MQ=255) gTTCGGTGCGGGGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACAATAATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGcg > 1:1075940/1‑149 (MQ=255) gtgcggtgAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCgg < 1:1039330/150‑1 (MQ=255) gtgcggtgAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCgg < 2:2256166/150‑1 (MQ=255) gtgAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGc < 2:1440383/150‑1 (MQ=255) acCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGAtt < 2:1631457/150‑1 (MQ=255) tGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCg > 2:585545/1‑131 (MQ=255) tGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCg < 1:585545/131‑1 (MQ=255) gTACCCAGGGCGACATCGTCCGGAGCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCGGCTTAACCACCCCATGGCTGAACAGGGCGTAGGCATGATAAAGCCGTCGGGCACCGAGCAGATTGTCggcc < 2:795868/150‑3 (MQ=255) ccAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGAcc > 2:2173645/1‑74 (MQ=255) ccAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGAcc < 1:2173645/74‑1 (MQ=255) gTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAg < 1:784896/150‑1 (MQ=255) tCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCCAGCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAgg < 2:71637/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCggg < 2:935488/115‑1 (MQ=255) tCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCggg > 1:935488/1‑115 (MQ=255) tGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTa > 2:2002888/1‑150 (MQ=255) gACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCt < 2:2083036/150‑1 (MQ=255) gACCATCATGGGCCGCCTGGGTGACAAGGCTAGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCt > 2:1779661/1‑150 (MQ=255) catcatGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAg < 2:1827228/86‑1 (MQ=255) catcatGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAg > 1:1827228/1‑86 (MQ=255) atcatGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATc > 2:1459412/1‑150 (MQ=255) atcatGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATc > 1:1474924/1‑150 (MQ=255) tcatGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAg > 1:412323/1‑84 (MQ=255) tcatGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAg < 2:412323/84‑1 (MQ=255) catGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGa < 2:2154309/150‑1 (MQ=255) gggCCGCCTGATAGGTAATGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTc < 2:1590753/150‑1 (MQ=255) gcactggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGACTCCAAgg > 2:1258365/6‑150 (MQ=255) actggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGAc > 2:781371/4‑150 (MQ=255) tGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACa > 1:208660/1‑150 (MQ=255) ctggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACa < 1:781371/148‑1 (MQ=255) ctggTGGCGAGCCTTGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGANTGTCGGNCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACa < 1:1258365/148‑1 (MQ=255) gggTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACAt > 1:884384/1‑150 (MQ=255) tGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAg > 2:1335587/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGc > 1:2044409/1‑150 (MQ=255) cAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAgggg > 2:2181788/1‑147 (MQ=255) gCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGAtt > 1:1545843/1‑93 (MQ=255) gCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGAtt < 2:1545843/93‑1 (MQ=255) | AGCAGGTTACCGAGCTGGACCTGGGCCGCTTCAACGTGCCGCTGCTGCTGATTGCCCCGGGCATTCAGGAGAAGTTCGGTGCGGTGAATCACACCGTGGGTACCCAGGTCGACATCGTGCCGACCATCATGGGCCGCCTGGGTGGCAAGGCTCGCCACCAGTGCTGGGGGCGCGACCTGCTCAACCTGCCCGAGGGTGACCAGGGCGTAGGCATGATCAAGCCGTCGGGCAGCGAGCAGATTGTCGGGCTGGTGCAGGGTGACCGTATCCTGATCGAGTCCAAGGACATGAGCCC > NC_002947/2062732‑2063026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |