Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,799,214 | 0 | A | G | 8.1% | 280.7 / 8.6 | 99 | intergenic (‑185/+31) | PP_2452/ansB | hypothetical protein/glutaminase‑asparaginase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/44); new base G (4/4); total (50/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TATTTCACTGTAAGTAAATTCGCAACAGCTTGTCAGGAGAAATCCAGCGTTGGCCTGTAAACCATGAGGCCGGTCAGAAAGGTAAACGATGTCGCCGGTTTGTAACCTCTGTGTCTACGCGGTTGAGGAATTGGCAACGAGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGACCCAGTCGTTCT > NC_002947/2799065‑2799363 | tATTTCACTGTAAGTAAATTCGCAACAGCTTGTCAGGAGAAATCCAGCGTTGGCCTGTAAACCATGAGGCCGGTCAGAAAGGTAAACGATGTCGCCGGTTTGTAACCTCTGTGTCTACGCGGTTGAGGAATTGGCAACGAGGCCCTCaga > 1:1707995/1‑150 (MQ=255) aCTGTAAGTAAATTCGCAACAGCTTGTCAGGAGAAATCCAGCGTTGGCCTGTAAACCATGAGGCCGGTCAGAAAGGTAAACGATGTCGCCGGTTTGTAACCTCTGTGTCTACGCGGTTGAGGAATTGGCAACGAGGCCCTCAGGGCCggt > 2:1292616/1‑149 (MQ=255) gtaaATTCGCAACAGCTTGTCAGGAGAAATCCAGCGTTGGCCTGTAAACCATGAGGCCGGTCAGAAAGGTAAACGATGTCGCCGGTTTGTAACCTCTGTGTCTACGCGGTTGAGGAATTGGCAACGAGGCCCTCAGGGCCGGTGCGCCgg > 1:740743/1‑150 (MQ=255) 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tGGCAACGAGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAg < 1:81804/150‑1 (MQ=255) ncAACGAGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCNGCCCTGAGGGGAAAGCACNCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGAAGCGTTTTGCGATCCTTGGTCTTGGTCATCGCTACGATCACCAGTATCCGGGCTTTTTGCGGGTTCACGTAGAGAGcc > 1:522292/2‑150 (MQ=255) cAACGAGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCa < 1:1836570/150‑1 (MQ=255) ttcccccTCAGGGCCGGTGCGCCGGCTCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGAc > 1:1051374/5‑150 (MQ=255) aGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGAcc < 1:1677881/150‑1 (MQ=255) aGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGAcc > 1:1804536/1‑150 (MQ=255) gCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTc < 1:1722926/85‑1 (MQ=255) gCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTc > 2:1722926/1‑85 (MQ=255) gCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTTCGGGTTCAGGGCGTGAGCCACGGCCCa > 2:1067977/1‑150 (MQ=255) cccTCAGTGCCGGTGCGCCGGCTCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTgg < 1:1917313/81‑1 (MQ=37) cccTCAGGGCCGGTGCGCCGGCTCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTgg > 2:1917313/1‑81 (MQ=25) cTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGACCCAGTc < 2:1549037/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGACCCAGTc > 1:1412668/1‑150 (MQ=255) agCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGACCCAGTCGTTCt < 2:1412668/150‑1 (MQ=255) | TATTTCACTGTAAGTAAATTCGCAACAGCTTGTCAGGAGAAATCCAGCGTTGGCCTGTAAACCATGAGGCCGGTCAGAAAGGTAAACGATGTCGCCGGTTTGTAACCTCTGTGTCTACGCGGTTGAGGAATTGGCAACGAGGCCCTCAGAGCCGGCGCACCGGCCCTGAGGGGGAAGCACTCAGTACTCCCAGAAGATCCGCTGCAGCTCTTTGCTGTCCTGGGTCTTGGTCATCGCTACCATCGCCAGGATCCGCGCTTTTTGCGGGTTCAGGTCGTGAGCCACGACCCAGTCGTTCT > NC_002947/2799065‑2799363 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |