| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4340085 = | 47 (0.710) | 17 (0.350) | 14/198 | 2.9 | 45.4% | intergenic (+26/‑305) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 4340169 = | 6 (0.120) | intergenic (+110/‑221) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein | |||||
CCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTG > NC_002947/4340041‑4340310 | cccGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGGTTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa < 1:744328/150‑1 (MQ=255) gggATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGATTACCCGCGAATGAGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGa > 2:21615/1‑150 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCAGACTATGata < 2:170741‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTg > 2:296848‑M1/1‑119 (MQ=255) GGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTg < 1:296848‑M1/119‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa > 1:1140623‑M2/62‑83 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGa < 2:1140623‑M2/22‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGAt < 1:138105‑M2/27‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGAt > 2:138105‑M2/62‑88 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGccc > 1:219088‑M2/62‑100 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGccc < 2:219088‑M2/39‑1 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:539950‑M2/62‑121 (MQ=255) ccgcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:539950‑M2/60‑1 (MQ=255) CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGAt < 2:1387624‑M1/88‑1 (MQ=255) CCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGAt > 1:1387624‑M1/1‑88 (MQ=255) CGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGTTCGCCCCATa < 2:1407925‑M1/103‑1 (MQ=255) CGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATa > 1:1407925‑M1/1‑103 (MQ=255) gcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa > 1:1228676‑M2/60‑145 (MQ=255) gcgaatgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa < 2:1228676‑M2/86‑1 (MQ=255) GAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGGAAACCCGCGCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTAACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCACACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTg < 2:126605‑M1/150‑1 (MQ=255) atgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTg < 1:821852‑M2/3‑1 (MQ=255) atgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTg > 2:821852‑M2/56‑58 (MQ=255) tgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:1362691‑M2/55‑115 (MQ=255) tgcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:1362691‑M2/61‑1 (MQ=255) gcgtcggtggtgtcaccctcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTc > 1:286638‑M2/54‑150 (MQ=255) GAGGGTGACACCACCGAGGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTAGCCCCATa < 1:1075515‑M1/94‑1 (MQ=255) GAGGGTGACACCACCGAGGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTAGCCCCATa > 2:1075515‑M1/1‑94 (MQ=255) GAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:1002999‑M1/1‑111 (MQ=255) GAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:1002999‑M1/111‑1 (MQ=255) ggtggtgtcagcctcgcattcacgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGAAAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAg > 2:795531‑M2/49‑150 (MQ=255) accaccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGc > 2:931631/1‑150 (MQ=255) accGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa < 2:1106092/125‑1 (MQ=255) accGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTa > 1:1106092/1‑125 (MQ=255) accGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCAcc < 1:21615/150‑1 (MQ=255) tcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTAGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACa > 2:412309‑M2/36‑150 (MQ=255) cgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACaa > 1:477131‑M2/35‑150 (MQ=255) cgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTCGCCAGAATTTTTGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACaa > 1:1591748‑M2/35‑150 (MQ=255) gcattcgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAAt > 2:780118‑M2/34‑150 (MQ=255) tcgcgggtaaacccgctcctacaggggccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTaaa < 2:286638‑M2/121‑1 (MQ=255) cgcgggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTaaaa > 1:136633‑M2/29‑150 (MQ=255) gggtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACg > 1:924292‑M2/26‑150 (MQ=255) gtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCtt < 1:604366‑M2/49‑1 (MQ=255) gtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCtt > 2:604366‑M2/24‑72 (MQ=255) gtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:976465‑M2/60‑1 (MQ=255) gtaaacccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:976465‑M2/24‑83 (MQ=255) acccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGc > 1:868311‑M2/20‑123 (MQ=255) acccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGc < 2:868311‑M2/104‑1 (MQ=255) cccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGccacca > 2:1234101‑M2/19‑150 (MQ=255) ccgctcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAg > 1:1064837‑M2/18‑150 (MQ=255) tcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTg > 1:828130‑M2/14‑112 (MQ=255) tcctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTg < 2:828130‑M2/99‑1 (MQ=255) ctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg > 1:851510‑M2/12‑72 (MQ=255) ctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTg < 2:851510‑M2/61‑1 (MQ=255) ctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATa < 2:62051‑M2/66‑1 (MQ=255) ctacagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATa > 1:62051‑M2/12‑77 (MQ=255) cagggcccTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTg < 1:1234101‑M2/142‑1 (MQ=255) | CCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACAATTAAAAACGGCCACCAGAACACTTTG > NC_002947/4340041‑4340310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |