Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 542,698 | G→C | R312P (CGT→CCT) | rpoC → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 542,698 | 0 | G | C | 98.5% | 228.3 / NA | 67 | R312P (CGT→CCT) | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (33/33); total (33/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCG > NC_002947/542560‑542832 | aCGACCTGTATCGCCGGGTGATCCACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCa < 1:1475043/150‑1 (MQ=255) gACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATc < 2:78575/150‑1 (MQ=255) cTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTc < 2:1532642/139‑1 (MQ=255) cTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTc > 1:1532642/1‑139 (MQ=255) tGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCGGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTg < 1:710832/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGaa < 2:1612803/150‑1 (MQ=255) ggTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACaa < 2:1326775/150‑1 (MQ=255) aTCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGCACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCGATCACTGGCTCGAACAAGCGt < 2:677055/150‑1 (MQ=255) tCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTc > 1:401517/1‑150 (MQ=255) ccGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCt > 1:411998/1‑150 (MQ=255) cGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTg < 2:1478027/150‑1 (MQ=255) tAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGaa < 2:401517/150‑1 (MQ=255) caacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGACGTGCTGGTCGCGCCATCACTGGGTAGAACAAGCGTCAGCTGACGTc > 1:617911/1‑150 (MQ=255) caacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCACCGGACATCATCGGGCGCAACGAAAAGCGCATACATTTTGTAGCGGTTCAATCAGTGCGATGCAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAACATCGGCTGAAGTc > 1:1338633/1‑150 (MQ=255) aacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGaa < 2:269574/146‑1 (MQ=255) aacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGaa > 1:269574/1‑146 (MQ=255) aacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTcc < 2:411998/150‑1 (MQ=255) aacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTcc > 1:1328790/1‑150 (MQ=255) aacCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTcc > 2:582824/1‑150 (MQ=255) ccGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCt < 2:1328790/150‑1 (MQ=255) cagTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGATGCAGGAGGCGGTTCCAGCTCTGCTGGCCAGCTGCCGTCGTGGCCGCGCTATCATTTGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCt < 1:1473920/148‑1 (MQ=255) cGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTg > 1:1479908/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCCTTGTGATCTGCTGAAAGCGCGTTTTGCAGGAAGCGGTTGCCGCTCTGCTGGACAACGTCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACa < 1:1585420/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGAt > 1:110484/1‑150 (MQ=255) ctgctgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACaa < 2:1077922/119‑1 (MQ=255) ctgctgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACaa > 1:1077922/1‑119 (MQ=255) tgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAg < 1:973536/150‑1 (MQ=255) tgGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAg < 1:582824/150‑1 (MQ=255) ggATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAgg > 1:1223116/1‑150 (MQ=255) aTCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTa > 2:24660/1‑150 (MQ=255) tCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTaa < 2:1479908/150‑1 (MQ=255) tCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTaa < 1:24660/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCAt > 2:1475095/1‑92 (MQ=255) tCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCAt < 1:1475095/92‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCaa > 1:904787/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAg < 1:221080/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATc < 1:1459879/136‑1 (MQ=255) ggCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATc > 2:1459879/1‑136 (MQ=255) cgcCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTc < 2:1403539/150‑1 (MQ=255) gcCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCg > 1:829238/1‑150 (MQ=255) gcCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAACGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTGCGCTGAAGTCCCTCGCCGACATGATGAAAGGTAAGCAAGGTCg > 2:621055/1‑150 (MQ=255) catcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCa > 1:229186/1‑150 (MQ=255) catcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCa < 2:260691/150‑1 (MQ=255) atcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAg > 2:1459061/1‑150 (MQ=255) tcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGc < 2:245232/93‑1 (MQ=255) tcGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGc > 1:245232/1‑93 (MQ=255) cGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGaa < 1:808597/150‑1 (MQ=255) gcgcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACtt < 2:1338633/150‑1 (MQ=255) gcAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGc > 1:659992/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTc > 2:839449/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTc > 1:681598/1‑150 (MQ=255) aaCGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTc > 2:1118691/1‑150 (MQ=255) aaGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAg > 2:1148010/1‑150 (MQ=255) gcgcATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACACGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCg > 1:588498/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGtt < 2:1223116/150‑1 (MQ=255) tgcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGtt > 1:340689/1‑146 (MQ=255) tgcAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGtt < 2:340689/146‑1 (MQ=255) aGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCgg < 2:659992/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGACGCTTTGCTGGTCAACGGCCGCCCTGGCCACGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGc > 2:1249197/1‑150 (MQ=255) ctctGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGc > 1:1391774/1‑70 (MQ=255) ctctGCTGGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGc < 2:1391774/70‑1 (MQ=255) ctctGCTGGAAAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTaa < 1:1148010/150‑1 (MQ=255) tgctgGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGtt < 2:500682/125‑1 (MQ=255) tgctgGACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGtt > 1:500682/1‑125 (MQ=255) tgGACAACGGCCTTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTTAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCg > 2:877170/1‑150 (MQ=255) gACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGc > 1:1153364/1‑132 (MQ=255) gACAACGGCCGTCCTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGc < 2:1153364/132‑1 (MQ=255) gtcctGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGaa > 1:936394/1‑43 (MQ=255) | ACGACCTGTATCGCCGGGTGATCAACCGTAACAACCGTCTGAAGCGCCTGCTGGATCTGTCGGCGCCGGACATCATCGTGCGCAACGAAAAGCGCATGCTGCAGGAAGCGGTTGACGCTCTGCTGGACAACGGCCGTCGTGGTCGCGCCATCACTGGCTCGAACAAGCGTCCGCTGAAGTCCCTGGCCGACATGATCAAAGGTAAGCAAGGTCGTTTCCGTCAGAACTTGCTCGGTAAGCGTGTTGACTACTCCGGCCGTTCGGTAATTACCG > NC_002947/542560‑542832 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |