| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NZ_LN832404 | 2,242,224 | +TAATTTTACCTTGTTGGCCATACAATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGT | 100% | intergenic (‑1/+2) | mglA ← / ← mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_LN832404 | = 2242224 | 0 (0.000) | 62 (0.940) +TAATTTTACCTTGTTGGCCATACAATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGT |
59/452 | NT | 100% | intergenic (‑1/+2) | mglA/mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB |
| ? | NZ_LN832404 | 2242225 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+1) | mglA/mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB | |||||
GGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATACTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCATCG > NZ_LN832404/2241941‑2242518 | tttaccctggaataaaatggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcagtttaataatgtcgaatttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑g < 2:330922‑M2/11‑1 (MQ=255) accctggaataaaatggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTg > 1:643069‑M2/282‑295 (MQ=255) ccctggaataaaatggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGa > 1:512628‑M2/281‑295 (MQ=255) ggaataaaatggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaaaaagtattccccggaggacggagtcgttgcgctgaccatataattttacattgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccactaagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTc > 1:249956‑M2/277‑295 (MQ=255) aaaatggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCa > 2:605063‑M2/272‑295 (MQ=255) aaatggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAg > 1:310785‑M2/271‑295 (MQ=255) tggtgccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGtt < 1:167963‑M2/28‑1 (MQ=255) gccggagtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggcggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaatcagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GATGAATTAAGCCAGGTtgttt > 2:569835‑M2/264‑293 (MQ=255) agtctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATc > 1:234876‑M2/259‑295 (MQ=255) tctttttgataaataccaaacaggcattttaataatgtcgattttcctgcaccgttttcccccattaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTa < 1:371234‑M2/39‑1 (MQ=255) 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attaatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCAc > 1:364269‑M2/194‑295 (MQ=255) taatgcatggatagaatgtggccggacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCt < 1:393628‑M2/104‑1 (MQ=255) gatagaatgtggcccgacttttaaattaacgttatcaagtgccttaacaccaggaaaggacttgttgataccgctcatttccaacaagtattccccggaggacggagtcgttgagctgaccatataattttaccttgttggccatacaataagggcgcagtaatagactgcgcccaatcagtCTTATTTCTT‑GCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCg < 1:615219‑M2/113‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |