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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 1,636,491 | 0 | A | G | 54.0% | 25.2 / 238.9 | 163 | intergenic (‑552/‑53) | EK12AG100_RS08145/EK12AG100_RS25635 | MHS family MFS transporter/Rac prophage; protein YnaM |
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Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
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tAAGAACACCCAGGATAAAAATTGTCAACTATATCATATATAACA‑CATTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTTCGCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCTCTAATAAAATTAGGGCTTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCCATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATAAAA‑AGCAACCCTAAAGTGTTTCCCTGCGCAGCtatctgca > 2:133387/1‑288 (MQ=255) cccAAGATAAAAATTGTCAACTATATCATATATAACA‑CATTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACATCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAA‑AGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAAt < 2:196506/295‑1 (MQ=255) cAAGATAAAAATTGTAAAATATATCATATATAACA‑CAGTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACATCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAA‑AGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTa < 2:541799/295‑1 (MQ=255) | GCATAAGGTGTGTCTGCGGTTTTTCAACTATTCAGATACATCACTCCCATCACATTCATTCCTCCGCATCAAAGGCATATAGGCTATATCACCTTGATATTTTTCTTTTTCAGATAAAAACTGTTATCTATGTATACTTTTAAACCCAATCCGTGTAGAGTCTCTACATAAGATAGTTTGCAGTTGCCGCTTCAGCTTGCGCCATAAACCGCCTGATTTTTGCTGCCACCTGTTAGCATTCCTGTATACCTGAAACGACAATGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATTGTCAACTATATCATATATAACA‑CATTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACATCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAA‑AGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTA > NZ_LN832404/1636201‑1636783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |