| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_LN832404 | 3,862,813 | 0 | G | A | 87.4% | 240.6 / 22.8 | 87 | intergenic (‑28/+168) | EK12AG100_RS19170/ibpB | putative transporter/heat shock chaperone IbpB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/5); new base A (36/40); total (42/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
AGACGCGCAATGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTGATTGCTACGAATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGCGGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGG‑CTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAAGGTTGCGCCAGAGACTT > NZ_LN832404/3862521‑3863099 | agaCGCGCAATGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTGAt < 1:66898/295‑1 (MQ=255) gaCGCGCAATGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCCCTCATCGTCCCTTTCTCATGAAATAACCTTTTAAtt > 2:463518/1‑295 (MQ=255) aaTGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACgg < 1:463518/295‑2 (MQ=255) aaTGAGGCAAAGAAGCCCGGCCCTACCTGAATCCCGATAGTATAAACGAACAGGATCAGGCCAAATTCCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAAAAAAATGGCCGACGATGATACCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCAGCGAAACTTGACGTTGACGAAAAACCAAACGACGACTGCCACCAAAACCCAAATACTTACCGTTAATGCTATATCACACATAGTCCATTTCTATTGAGTAAACATTATAATTTCTAAGa > 2:594424/1‑295 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |