| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 3,021,900 | 1 | . | T | 90.9% | 290.6 / 22.2 | 88 | pseudogene (1246/1400 nt) | xanQ | xanthine/proton symporter XanQ |
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TAACCACGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑A‑TT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCA‑GCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTACGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTATTGAGGATGGTTTAT > NZ_LN832404/3021610‑3022186 | tAACCACGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTCCGATCCCGC‑A‑A‑tt‑tt > 1:464310/1‑295 (MQ=255) aaCCACGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGCCTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTGCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCGTCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑A‑tt‑ttt < 1:522081/295‑2 (MQ=255) ccACGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGGTTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTTAAACACTTATTGTCGCCCCTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCTGCCCCTACGATCCCGA‑A‑T‑TT‑TT‑taa > 2:726950/1‑295 (MQ=255) ccGTGTGCGCCAATTAAGGTGGTTAGTCCGGTGACGGGCGTTGCGTCACGTTATTGCTGTCGAACCATCGCGGGAATGCTGGTTATCTTCGGCTGTTTGCCGATGATTGGCGGCTTCGTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑A‑TT‑TT‑taaaa < 2:740014/294‑2 (MQ=255) aCGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑A‑TT‑TT‑taaaa > 1:594334/1‑294 (MQ=255) gTTTGCGCGAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCCGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAata > 1:578662/1‑295 (MQ=255) gTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTTGTGGCGCTTCACGTTATGGCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGTCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAata < 2:336967/295‑1 (MQ=255) ttGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATTACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATTGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCCCGACCATTCCCTTCGCCGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATTATTGCCATCGCAGGGATTCACATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCAGTGACACGCTTATTCTACCCACCTCTATAGGTTTCGGCATTTGCGTATCCTACTATCCAGA‑A‑T‑TT‑TT‑taaactatt > 2:117103/1‑290 (MQ=255) gcAAAAGAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCa < 1:412631/295‑1 (MQ=255) ataatGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAACGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGACCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCTGCctc > 1:873527/1‑295 (MQ=255) 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aGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGt > 1:396430/1‑295 (MQ=255) aGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGt > 1:407800/1‑295 (MQ=255) aTGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGCCGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTg > 1:454375/1‑295 (MQ=255) 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tcCTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCA‑GCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTATGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTAtt > 1:69083/1‑290 (MQ=255) ccTACGATCCCGA‑A‑ATTT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCA‑GCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTACGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTATTGAGGAt < 1:828577/295‑1 (MQ=255) cGATCCCGA‑A‑A‑TTGTT‑AAAATA‑GTGCCTGCCTCTATTTATTGATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCA‑GCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTACGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTATTGAGGATGGtt < 2:736848/295‑1 (MQ=255) 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TAACCACGTTTGCGCAAAATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATGACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTAGGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGA‑A‑A‑TT‑TT‑AAAATA‑TTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGCGGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATTATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCA‑GCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCGGTACGAGGCAGTTTTATTGATGTCACCCGTACGATCGATAACCCGGAAGAGATTGCCTCTGCGCTGCGGTTTATTGAGGATGGTTTAT > NZ_LN832404/3021610‑3022186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |