New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TTACGATGAAGCGACCGTCCGGCAGTGTTGATGGCGTCAAGAACTCTGACTGCATGCGTTAAAAATTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCCTGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTT‑CCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTCC > NZ_LN832404/1498442‑1499021 | gATGAAGCGACCGTCCGGCAGTGTTGATGGCGTCAAGAACTCTGACTGCATGCGTTAAAAATTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCCTGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTT‑CCATAAGCGATGTagactg < 2:315777‑M2/295‑7 (MQ=255) 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taccatAAGCGGTGGatactggccccctgaatcgccagacaagcaatataacgtaaataagttgtagtcttaataccagtgtgtagactagtcagtggagaagagaggagtgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccg > 2:177413‑M2/3‑15 (MQ=255) cATAAGCGATGTagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtacgcaataccaggaaggaagtcttcctgctgtcgccgccggcg < 2:122074‑M2/295‑284 (MQ=255) acaCGATGTTAAAAACTAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTGTATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTc < 1:295807‑M2/292‑1 (MQ=255) | TTACGATGAAGCGACCGTCCGGCAGTGTTGATGGCGTCAAGAACTCTGACTGCATGCGTTAAAAATTGTTCGCCGGGTAAGGTAAGTTGCGCCCCCTGACGACCACGCTCAAACAAGCGAGCGCCAGTCAGCTGCTCCAGTTCATTCAATGTCTTAGAGAGCGCAGGTTGACTCAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTT‑CCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTAAAGCAATTATGTTACAGCAAAATGGATAATATTGATGTTTTCGCGGCGAGATCACAGTTTGTAAATTCTTCCCGCAAGAGTGAATGCGGTTACCTACACTCCAGATTACTGACCACTGGAGGCAGACACTATGGCGAACAGCATCACGGCGGATGAGATTCGGGAACAGTTTTCGCAGGCAATGTCAGCCATGTACCAGCAAGAAGTTCC > NZ_LN832404/1498442‑1499021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |