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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
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tAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCa < 1:792543/295‑1 (MQ=255) ccTGATTAATTTCTGTCTGTCCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCagag < 1:66754/295‑1 (MQ=255) tAATTTCTGTCTGTCCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCAccc > 2:544517/1‑295 (MQ=255) | CGGGCGCTGGGCCACAGTACATAATTTTTCGACGATATGCGGCGGAGTCGCACCGTCCGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATATCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCAGTTCAGCGGTGATGTTAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCACTCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACG > NZ_LN832404/2500977‑2501553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |