| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NZ_LN832404 | 3,704,396 | 0 | A | G | 100.0% | 774.2 / ‑6.7 | 217 | intergenic (‑178/+565) | dppA/EK12AG100_RS23155 | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein DppA/RtT sRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (119/95); total (119/98) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AGATCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTATCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGA > NZ_LN832404/3704105‑3704687 | agaTCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTCAAATCTTTCa > 1:602528/1‑295 (MQ=255) 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AGATCCTTCTGAGCAATAAACCAGAGTTTTAGCCTGAACACTTGCTGCGACGGTCATAGCCACCAGGCTGAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTATCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGA > NZ_LN832404/3704105‑3704687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |