| Predicted mutation | |||||||
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| MC JC | NZ_LN832404 | 1,438,121 | Δ493 bp | 100% | [ttcA] | [ttcA] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| ? | NZ_LN832404 | 1438614 = | 0 (0.000) | intergenic (‑445/+225) | ttcA/uspF | tRNA 2‑thiocytidine(32) synthetase TtcA/universal stress protein UspF | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GGAATCTTCTCTTTCACGATACCGTAAGTATTCTCTTCAACAATCTTGTACTCAACGCCCAGCTTTTCAAGATACTCGGGCAGAACGTGTTCCGGGAAGCCCGGTTGCTTTTGATCGAGGTTAACAGCCACCAGCGAAAAATTGATTGGCGCGCTTTGCTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTCTTCAACAATCTTGTACTCAACGCCCAGCTTTTCAAGATACTCGGGCAGAACGTGTTCCGGGAAGCCCGGTTGCTTTTGATCGAGGTTAACAGCCACCAGCGAAAAATTGATTGGCGCGCTTTGCTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAAT > NZ_LN832404/1437823‑1438415 | ggAATCTTCTCTTTCACGATACCGTAAGTATTCTCTTCAACAATCTTGTACTCAACGCCCAGCTTTTCAAGATACTCGGGCAGAACGTGTTCCGGGAAGCCCGGTTGCTTTTGATCGAGGTTAACAGCCACCAGCGAAAAATTGATTGGCGCGCTTTGCTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATT < 1:19422‑M1/298‑1 (MQ=255) aaTCTTCTCTTTCACGATACCGTAAGTATTCTCTTCAACAATCTTGTACTCAACGCCCAGCTTTTCAAGATACTCGGGCAGAACGTGTTCCGGGAAGCCCGGTTGCTTTTGATCGAGGTTAACAGCCACCAGCGAAAAATTGATTGGCGCGCTTTGCTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTtg < 2:353572‑M1/298‑3 (MQ=255) cttccCGTTCAAGATACCGTAATGATTCTCTTCAACAAACTTGTACTCAACGCCCAGCTGTTCAAGATACTCGGGCAGAACGTGTTCCGGGAAGCCCGGTTGCGTTTGATCGAGGTTAACAGCCACCAGCGAAAAATTGATTGGCGCGCTTTGCTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTtgttc < 2:653684‑M1/298‑6 (MQ=255) gctcttTCACGATACCGTAAGTATTCTCTTCAACAATCTTGTACTCAACGCCCAGCTTTTCAAGATACTCGGGCAGAACGTGTTCCGGGAAGCCCGGTTGCTTTTGATCGAGGTTAACAGCCACCAGCGAAAAATTGATTGGCGCGCTTTGCTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACGTTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTtgttcag < 1:998823‑M1/297‑8 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |