| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_LN832404 | = 1423461 | NA (NA) | 123 (1.190) +TATTGTATGGCCAACAAGGTAAAATTA |
111/518 | NT | 100% | intergenic (+148/‑125) | EK12AG100_RS07185/EK12AG100_RS07190 | IS5‑like element IS5 family transposase/DUF2534 family protein |
| ? | NZ_LN832404 | = 2242224 | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+2) | mglA/mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AGGTTTAACTCCTGGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATACTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCATCGCAT > NZ_LN832404/2241928‑2242521 | gTTTAACTCCTGGTGTACCATCGAAATACCAATTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCGGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAGGAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATAtaa > 2:551460‑M2/1‑295 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |