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cGAGAAGAATTTCCCTGCTTATTCGCACCTTCCATAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAACTCGCAGCCCCCCACCGTTGTATGCGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATCTAGGAAAAATCTTAGATAAGCGTAAAGACCCATTCCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTCCAGCAACTATCCTAATTCCAATTATTTTTTAACGGGCATTCCCGCCGGCTTCCCGGCGTGCGGTgaaccccaca > 2:973905/1‑290 (MQ=14) cGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTCTAATGCTAATTATTTTTTACCGGGGCTTCCCGGCGCCATCACGGGGTGCGGTgaaaccgcat > 1:118743/1‑290 (MQ=255) cGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTCTAATGCTAATTATTTTTTACCGGGGCTTCCCGGCGACATCACGGGGTGCGGTgaaaccgcat > 2:445542/1‑290 (MQ=255) cGAGAAGAACTTCCCCGCTTATTCGGACCGTCCTTAAGGAAGTGAGGGTTTTGTGTTATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTCTAATGCTAATTATTTTTTACCGGGGCTTCCCGGCGACATCACGGGGTGCGGTgaaaccgcat < 2:944083/298‑9 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGATGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTATAATGCTAATTATTTTTTACCGGGGCTTCCCGGCGACATCACGGGGAGCGGTgaaaccgcata > 1:765968/1‑289 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTCTAATGCTAATTATTTTTTACCGGGGCTTCCCGGCGACATCACGGGGTGCGGTgaaaccgcata < 1:907258/298‑10 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTCTAATGCTAATTATTTTGTACGGGGGCTTCCCGGCGACACCAAGGGTTGCGGTgaaaccgcata > 2:618631/1‑289 (MQ=255) aagaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTCCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCCACACTATTCTACTGCTAATTATTTTTTACCGGGACTTCCCTGCGCCCTCCCGGGGTGCGGtcacaccgcagacaa > 2:674473/1‑284 (MQ=14) | ATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAAGTAATTGAGTGTTTTGTGTGATCTGCATCACGCATTATTGAAAATCGCAGCCCCCCTCCGTTGTATGTGCGTGT‑AGTGACGAGTACAGTTGCGTCGATTTAGGAAAAATCTTAGATAAGTGTAAAGACCCATTTCTATTTGTAAGGACATATTAAACCAAAAAGGTGGTTCTGCTTATTGCAGCTTATCGCAACTATTCTAATGCTAATTATTTTTTACCGGGGCTTCCCGGCGACATCACGGGGTGCGGTGAGGAGAAAAAATC > NZ_LN832404/3127507‑3127912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |