| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NZ_LN832404 | 1,123,847 | 0 | G | A | 100.0% | 453.4 / ‑6.7 | 120 | intergenic (+494/‑49) | putP/EK12AG100_RS05615 | sodium/proline symporter PutP/FTR1 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (62/56); minor base C (2/0); total (64/56) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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cGATTTACTTTTCTTTGCATAGATTGACTCAGAAAAACGTTTAAGGGTGGGTGGCATGTTTGTTCCGTTTCTCATTATGTTGCGCGAAGGACTTGAAGCCGCGCTGATTGTCAGTTTGATTGCCAGCTATCTTAAGCGTACCCAGCGAGGCCGATGGATTGTGTGATGTGGATTGGCGTGTTGCTTGCCGCTGCGTTGTGCCTGGGCTTGGGTATCTTCATTAACGAAACCACCGGCGAACTTCCGCAAAACGAAAGGGAACTGGTTGGAGGTAGCGTGGCGGGGCTCGcgggtggtg > 2:402332/1‑290 (MQ=255) gATTTACTTTTCTTTGCATAGATTGACTCAGAAAAACGTTTAAGGGTGGGTGGCATGTTTGTTCCGTTTCTCATTATGTTGCGCGAAGGACTTGAAGCCGCGCTGATTGTCAGTTTGATTGCCAGCTATCTTAAGCGTACCCAGCGAGGCCGATGGCTTGTGTGATGTGGATTGGCGTGTTGCTTGCCGCTGCGTTGTGCCTGGGCTTGGGTATCTTCATTAACGAAACCACCGGCGAATTTCCGACAAAAGAACAGGAACTGTTTGAAGGTATCGTGGCGGTGATAGCCGTGGTGAt > 1:10658/1‑298 (MQ=255) aTTTACTTTTCTTTGCATAGATTGACTCAGAAAAACGTTTAAGGGTGGGTGGCATGTTTGTTCCGTTTCTCATTATGTTGCGCGAAGGACTTGAAGCCGCGCTGATTGTCAGTTTGATTGCCAGCTATCTTAAGCGTACCCAGCGAGGCCGCTGGATTGTGTGATGTGGATTGGCGTGTTGCTTGCCGCTGCGTTGTGCCTGGGCTTGGGTATCTTCATTAACGAAACCAACGGCGAATTTCCGCAAAAAGAACAGGAACTGTTTGAAGGTATCGTGGCGGGGATCGCCGTGGTGAta > 1:92353/1‑297 (MQ=255) | AAAAGTTAGATTTGATAATCGCGGATGGACGAAATTGCTTGATACACCCGCTTATCAGTTTTACATGGAAGCTCTGATGCATTGAGTCTGGACAGTTTTGTCGGCTGGATACGGCGTTTACGCGGCATCCGGCAAGAACACATGGTTCTTTGCAAACAATCCCATCTTTCTACCCTGGAATAATCGTTTATATCCCTTGGCATTACCTCTCTTTGTTTACATTCCAACATCATTTTATAAACATTCCGCTTGTGTTTTTCTTTGCCGTAATGATAATCGCTATCACTGCGATTTGCTTTTCTTTGCATAGATTGACTCAGAAAAACGTTTAAGGGTGGGTGGCATGTTTGTTCCGTTTCTCATTATGTTGCGCGAAGGACTTGAAGCCGCGCTGATTGTCAGTTTGATTGCCAGCTATCTTAAGCGTACCCAGCGAGGCCGATGGATTGTGTGATGTGGATTGGCGTGTTGCTTGCCGCTGCGTTGTGCCTGGGCTTGGGTATCTTCATTAACGAAACCACCGGCGAATTTCCGCAAAAAGAACAGGAACTGTTTGAAGGTATCGTGGCGGTGATCGCCGTGGTGATC > NZ_LN832404/1123553‑1124140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |