| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NZ_LN832404 | 2,523,883 | Δ120 bp | 89.6% | [EK12AG100_RS12585] | [EK12AG100_RS12585] | |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_LN832404 | = 2523882 | 12 (0.110) | 59 (0.750) | 55/406 | NT | 89.6% | noncoding (76/76 nt) | EK12AG100_RS12580 | tRNA‑Val |
| ? | NZ_LN832404 | 2524003 = | 5 (0.060) | intergenic (+1/‑46) | EK12AG100_RS12585/EK12AG100_RS12590 | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
CATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCG‑GCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTACTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTTTGAGTTGAGCGCAGCGA > NZ_LN832404/2523714‑2524292 | tgaaaaattaagtcggcggtattctatcactcccgcctgattcctcaatgtagttcgggtttctaccttacgcattattgttttcgttgacaaattgcgcaacacggtctgttttgcgatcatcttgcttaaatttacgacgaacgaacaatttctttagaaaatgcgttgactcattttgaactctccctataatgcgactccacacagcgggggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccac < 1:150250‑M2/1‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |