Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_LN832404	1982233	1982527	295	47 [45]	[46] 47	flhD/uspC	flagellar transcriptional regulator FlhD/universal stress protein UspC

TTTCAATCTGTTAAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCC  >  NZ_LN832404/1982434‑1982816                                                                                               |                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaagaaaggcaacaatcaacttaatgttAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttaca                                                                                               >  1:1001025‑M1/14‑135 (MQ=255)   agaaaggcaacaatcaaattaatgTTAATTAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGGTTAATGCGGAGATTCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacacc                                                                                             <  1:768341‑M1/279‑158 (MQ=255)        gtgaacaatcaactTAATGTTAAAGAAAAGTTTTACATATATTAACCACTTGGTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTGCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaa                                                                                        <  2:536020‑M1/284‑163 (MQ=255)         gcaacaatcaacTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaatacggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaag                                                                                       >  1:673‑M1/6‑127 (MQ=255)         gcaacaatcaacTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatcttcttgtcgctgttgcggttacaccggaaag                                                                                       >  1:924506‑M1/6‑127 (MQ=255)         gcaacaatcaacTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaag                                                                                       <  2:971607‑M1/285‑164 (MQ=255)           aacaatcaACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtc                                                                                     >  1:573921‑M1/4‑125 (MQ=255)            acaaTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGaaa                                                                                    <  2:50696/288‑1 (MQ=255)              aaTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagc                                                                                  <  1:517955‑M1/290‑169 (MQ=255)              aaTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtaagc                                                                                  >  1:689633‑M1/1‑122 (MQ=255)              aaTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagatatcgcaatattcttgtcgatgttgcggttaacccggacagtccgc                                                                                  >  2:830077‑M1/1‑122 (MQ=255)               aTCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatggcaatattcttgtagctgttgcggttacaccggaacgtcagga                                                                                 >  2:512015‑M1/1‑121 (MQ=255)                             aatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTTTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTCATGTCACCTGCAGTTCACAGAATAAGGAAACGTTTCTGCGCTATACAAATCTTATTTTCACTGTTGCTGTTCACCCGGACCGTCAGCACATGCTAGCa                                                                   >  2:848248/1‑290 (MQ=255)                             aatgAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACATGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAAGATTCTTGTCGCTGTTGCGGTGTCAACGGAAAGTGAGCAActgagtgca                                                                   >  2:981663/1‑284 (MQ=255)                                 aaaTGGTGTAAAGATATTAAACAACTGTGTAATGCGTAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACAGTTGACATTATATGATCACCTGTAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATGTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGGTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAg                                                               <  2:889991/290‑1 (MQ=255)                                    tGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatc                                                            <  1:108827‑M1/290‑191 (MQ=255)                                        ttACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacacctgaacgtcaacaactgcttgccaaagcggtttatatc                                                        >  2:572447‑M1/1‑96 (MQ=255)                                        ttACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaacgcggtatctatc                                                        >  1:419797‑M1/1‑96 (MQ=255)                                         tACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATTAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAAGTATATGATTACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGtatct                                                       <  2:202899/290‑1 (MQ=255)                                          aCATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtagctgttgcggttccaccggaaagtcagcaactgcgggccaaagcggtatctatcgc                                                      >  2:650770‑M1/1‑94 (MQ=255)                                               tatTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagcctaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggcacaggttatgagctatagcaatattcttgtcactgttgcggttacaccggaaagtccgcaactgctggcacaagctgtatctatcgccagtc                                                 >  2:516209‑M1/1‑89 (MQ=255)                                               tatTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacacc                                                                                             >  1:400956‑M1/1‑89 (MQ=255)                                               tatTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacacc                                                                                             <  2:400956‑M1/246‑158 (MQ=255)                                                atTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggcc                                                <  1:168267‑M1/290‑203 (MQ=255)                                                atTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAACGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTAAACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCggagacttcgaccg                                                >  2:576383/1‑278 (MQ=255)                                                  tAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaacgtcagaaactgctggcaaaagcggtatctatcgcaaggccag                                              >  1:587390‑M1/1‑86 (MQ=255)                                                     ccACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaa                                           >  1:103652‑M1/1‑83 (MQ=255)                                                       aCTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaag                                         >  2:271032‑M1/1‑81 (MQ=255)                                                         ttGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaaggg                                       >  1:755264‑M1/1‑79 (MQ=255)                                                         ttGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagacatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaaaggatggacaacgcggtacatatcgccaaggcagaacacgt                                       >  2:541611‑M1/1‑79 (MQ=255)                                                           gTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAg                                     >  1:125757/1‑290 (MQ=255)                                                               aaTGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcaaagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagaaactgctggcaaaagcggtatctatcgcaaggccaggaaggggcaacag                                 >  1:276885‑M1/1‑73 (MQ=255)                                                                 ttaggagaATCAGTAAAATATTTTCTTATAATGACATTTGAAATTATATGATAACCGGGAGGGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaagggacacatca                               <  2:911244‑M1/287‑220 (MQ=255)                                                                  gCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaagggacacatcag                              >  1:201584‑M1/1‑70 (MQ=255)                                                                     gagaATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggaataaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgcttttgcggttacacaggaacgtcagcaactactggcaaaagcggtatctattgccaggccagacaagggccacatcagttc                           >  2:692515‑M1/1‑67 (MQ=255)                                                                      agaATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCTCTTTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAAATGCTGGCAACAGCGGTATCTATCGCCAGGCCCGTAACGGGCCACATCAg                          >  1:756321/1‑290 (MQ=255)                                                                       taatatgTACATTATTTTGTTATAAGTGCATTTGAAATTATAAGTTCCCTGGGAGTG‑‑TG‑‑TGAGTATATGTACTAATAAACATAGTAATATTTACGTTTTTGACACGGTGGGTATTGCGTCGTTTATCCATGTGGAGTAAAGCTGTAATGTCCCCTTTAGTTCACAGAATAAGGAACAGGATATGAGCTATAGCACTATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCTAGGCCAGTAAAGGGAAACATCAGTTTaa                     <  2:261053/284‑1 (MQ=255)                                                                       gaATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCGCCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAGGGACACATCAGt                         >  1:126524/1‑290 (MQ=255)                                                                       gaATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGACGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGATAGTCAGCAACTGCTGGCCAAAGCGGTATCTATTGCCCGGCCAGTAAAGGGACACATCCGt                         >  2:884614/1‑290 (MQ=255)                                                                       gaATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCACGGCCCGTAAAGGGACCAATCAgg                         >  2:1038576/1‑289 (MQ=255)                                                                        aaTCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgcaaggccagtaaagggacacatcagtttaat                        >  1:678867‑M1/1‑64 (MQ=255)                                                                         atacttaaagagttttcttataagttaaTTGTCAATTATATGATGACTGGGAGTGATTGATTAtctttacttatagtcagactaatatttacctgtttgaccgagttgggattgtgtagtgtctccattaggagtaaagctttaatgtaacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaagggacacatcagtttaatt                       <  2:212819‑M1/278‑228 (MQ=255)                                                                           cAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAtctttactaataatcagaccaatatttacctgtttgaccgagttgggattgcgtcgtttctccattaggagtaaagctttaatgtcacctgaagttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttgtcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctggcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaagggacacatcagtttaattac                     <  1:682505‑M1/290‑230 (MQ=255)                                                                                   tATTTTCTTATAATTTCATTTGAAATTATATGGTAACCTGGAGTGATTGATTAgctttactaataattagactaatagttacctgtttgaccgagttgggattgcggcgttactccattaggagtaatgctttaatttcacctgaatttcacagaataaggaacaggttatgagctatagcaatattcttttcgctgttgcggttacaccggaaagtcagcaactgctgtcaaaagcggtatctatcgccaggccagtaaagggacacatcagtttaattactctcgctt             <  2:980998‑M1/290‑238 (MQ=255)                                                                                    aTTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATAGGAGCACCGTGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCg            <  2:34856/290‑1 (MQ=255)                                                                                           ttttaTTTCATTTGAAATTATATGATAACCGTGAGTTATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCGGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGa     <  2:761383/286‑1 (MQ=255)                                                                                              aaTTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGAccc  <  1:857931/290‑1 (MQ=255)                                                                                               |                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTCAATCTGTTAAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTTTTACATATATTAACCACTTGTTTAATGCGGAGAATCAGTACACTATTTTCTTATAATTACATTTGAAATTATATGATCACCGGGAGTGATTGATTAATTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGTTGCGGTTACACCGGAAAGTCAGCAACTGCTGGCAAAAGCGGTATCTATCGCCAGGCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCC  >  NZ_LN832404/1982434‑1982816

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑