| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 2,501,268 | 0 | C | A | 84.7% | 335.8 / 49.6 | 127 | intergenic (‑97/‑279) | EK12AG100_RS12470/EK12AG100_RS12475 | alanine transaminase/two‑component system sensor histidine kinase YpdA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/8); new base A (51/56); total (63/64) | |||||||||||
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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CTGGGCCACAGTACATAATTTTTCGACGATATGCGGCGGAGTCGCACCGTCCGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATATCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCAGTTCAGCGGTGATGT‑TAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCAC‑TCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGA > NZ_LN832404/2500983‑2501554 | cTGGTCCAACGTACATAATTTGTCGACGATATGCGGCGGAGTCGCACCGTCCGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATAGCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCAGTTCAGCGGTGATGT‑TAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCAGCGt < 2:865347/290‑1 (MQ=255) 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tgtcCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCAC‑TCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCAc < 1:422613/290‑1 (MQ=255) tgtcCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCAC‑TCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCAc < 2:473641/290‑1 (MQ=255) tcCAGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCAC‑TCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTCCTAACCAGACGTGCATTATCACGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCACCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGCCCTGCTGGTCATCATCCTCAAGGTTACCTATCATAGAGATTTAATACTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGa > 2:77791/1‑290 (MQ=255) | CTGGGCCACAGTACATAATTTTTCGACGATATGCGGCGGAGTCGCACCGTCCGGGTTACCCATGCTGAAATCGATAATATCTTCGCCGCGCCGACGCGCAGCCATTTTCAGTTCAGCGGTGATGT‑TAAAAACGTAGGGCGGGAGACGATCAATGCGCGTAAAGCGACGTTCAGGGCGAGTGTCAGCCATAATTTCCTCAGATTAACGTTAGCGCCCGGACCGTCCGAGCGACGCTGCCACGATGGTGGCTGTTTTGAAAATAGCCTGATTAATTTCTGTCTGTCCCGCGTTTTAGAACATTTTATTAATGACGTTAAATGAGGAACTCTGCTTTAAAAACAGGAAATTTATCTGCGCTAACAAGAAAATTACCAC‑TCATTTTATTAACATAATAATTTCAATAAATTTACTAACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATCAGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGA > NZ_LN832404/2500983‑2501554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |