| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 3,704,460 | 0 | A | C | 73.6% | 256.1 / 104.1 | 141 | intergenic (‑242/+501) | dppA/EK12AG100_RS23155 | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein DppA/RtT sRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (17/20); new base C (54/50); total (71/70) | |||||||||||
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Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
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cacaAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAA‑TCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGA‑CAATGGTTACTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTg > 1:13057/1‑290 (MQ=255) acacacaaAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGACAAAAA‑TCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAACACGCACAGCGGCACATGCCAGGGCCACCCATCAGTAACGCACAAATACATTTAAGCAAATATAAAAAACGA‑CAATGGCTTCTGTACCAACTCCGTTCATGGATaatca > 2:569361/1‑286 (MQ=255) acaaacaaAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAA‑TCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGA‑CAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTga > 1:847798/1‑290 (MQ=255) | GAGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTG‑ATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTATCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGA‑TTTACACCAAC‑GGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAA‑TCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGA‑CAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGA > NZ_LN832404/3704174‑3704746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |