Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_LN832404 | 3,715,942 | 0 | A | G | 75.9% | 250.0 / 91.0 | 138 | intergenic (‑385/‑49) | EK12AG100_RS18455/EK12AG100_RS18460 | DUF3053 domain‑containing protein/HTH‑type transcriptional regulator |
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Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GTAATCTTCCTGGTAAAATCATGGAGAAAATGAAACAAGGTTAATTTGTTGTTTCATTGTTAAAAAATGATAGTGCCGTTGCCTTTTTTGTAGCCAGAGATTTACGCCTTCGCAGAAGGTTAGATTTTCGAAATCTTTACAAAACAGGA‑GTGGTAAGAGATATATCGGCATTTATCAGATCGTTAGGTGGCTATAAGTCACGCTAAATGACAGGCTGAATCGAATCATAGCCAGAGCATGCCCTGACTTCACCCCGCTGTGTCTGCTTTTCCCGACTATTCTTAATAAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAA > NZ_LN832404/3715656‑3716225 | gTAATCTTCCTGGTAAAATCATGGAGAAAATGAAACAAGGTTAATTTGTTGTTTCATTGTTAAAAAATGATAGTGCCGTTGCCTTTTTTGTAGCCAGAGATTTACGCCTTCGCAGAAGGTTAGATTTTCGAAATCTTTACAAAACAGGA‑GTGGTAAGAGATATATCGGCATTTATCAGATCGTTAGGTGGCTATAAGTCACGCTAAATGACAGGCTGAATCGAATCATAGCCAGAGCATGCCCTTACTTCAACCCGCGGTGTCTGCTTTTCCCGACTATTCTTAATGAGc > 2:797791/1‑290 (MQ=255) 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cccGACTATTCTTAATGAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGt < 1:483724/290‑1 (MQ=255) tCTTAATGAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGACATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCAGGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTACAGTGCCGAACTa > 2:589826/1‑290 (MQ=255) cTTAATGAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGACGAACTaa > 1:1019139/1‑290 (MQ=255) | GTAATCTTCCTGGTAAAATCATGGAGAAAATGAAACAAGGTTAATTTGTTGTTTCATTGTTAAAAAATGATAGTGCCGTTGCCTTTTTTGTAGCCAGAGATTTACGCCTTCGCAGAAGGTTAGATTTTCGAAATCTTTACAAAACAGGA‑GTGGTAAGAGATATATCGGCATTTATCAGATCGTTAGGTGGCTATAAGTCACGCTAAATGACAGGCTGAATCGAATCATAGCCAGAGCATGCCCTGACTTCACCCCGCTGTGTCTGCTTTTCCCGACTATTCTTAATAAGCTTCGATGCAATTCACGATCCCGCAGTGTGATTTGAGGAGTTTTCAATGGAATATAAAGATCCAATGCATGAGCTGTTGAGCAGCCTGGAACAGATTGTTTTTAAAGATGAAACGCAGAAAATTACCCTGACGCACAGAACAACGTCCTGTACCGAAATTGAGCAGTTACGAAAAGGGACAGGATTAAAAATCGATGATTTCGCCCGGGTTTTGGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAA > NZ_LN832404/3715656‑3716225 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |