| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 3,725,952 | 0 | T | C | 76.8% | 210.7 / 71.5 | 112 | intergenic (‑69/+3) | xylB/xylA | xylulokinase/xylose isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/10); new base C (43/43); total (59/53) | |||||||||||
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Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ATACCCAATGCTTTAACGTCCTGCAGAGAATGCTGATCGCCCAGAGCTTT‑CATTGCGCGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCAC‑AG‑TTAGTTGTTATTTGTCGAACA‑GATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGTGACATTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCCGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCCAGCTCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGCGCCAGTGCCATCGTATCCATCGCGCCGATATGACCGTAAAACAGATCATATTTATCA > NZ_LN832404/3725666‑3726237 | aTACCCAATGCTTTAACGTCCTGCAGAGAATGCTGATCGCCCAGAGCTTT‑CATTGCGCGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCGCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCAC‑AG‑TTAgttgt < 2:660224/290‑1 (MQ=255) 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gCAC‑AG‑TTAGCCGTTATTTGTCGAACA‑GATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGTGCCATTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCAGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCACGCCCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGGCACAGTGCCAGGGTACCCACCCCCACGACATGTCCGTTAAACGGAACatct > 2:85561/1‑288 (MQ=255) gCAC‑AG‑TTAGCCGTTATTTGTCGAACA‑GATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGTGACATTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCCGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCCAGCTCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGCGCCAGTGCCATCGTATCCATCGCGCCGATATGACCGTAAAACAGATCatat < 1:480721/290‑1 (MQ=255) gg‑ttagctGTTATTGGT‑GTACAGGACAATGGTTTACCAAGTGTTCCGGTTGTTCCTGGCGACCAATCTAATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGGGCAAGTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCCGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCCAGCTCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGCGCCAGTGCCATCGTATCCATCGCGCCGATATGACCGTAAAACAGATCATATTTAt < 2:960767/289‑1 (MQ=255) | ATACCCAATGCTTTAACGTCCTGCAGAGAATGCTGATCGCCCAGAGCTTT‑CATTGCGCGATCAGTTGCCTGCCACCACTGTTCCGGGTCTTGTTCCGACCAGAGTGGATGCGGGCGCGAAACGGTCAGCTTTTCCGTTTGCGCAGCAACCACCTCACCCTGCTCGTTGAGCAAAATAACTTTTACGCCCGAGGTGCCAAGATCTATCCCGATATACATATCGATCGTTCCTTAAAAAAATGCCCGGTATCGCTACCGATAACCGGGCCAACGGACTGCAC‑AG‑TTAGTTGTTATTTGTCGAACA‑GATAATGGTTTACCAGATTTTCCAGTTGTTCCTGGCGACCACTCTGATGCACCGGAGACAAATGATGTTCCTGAGCATATTTGGCTAAATCTGCCAGTGACATTTGGCCTTTCAGGATTTGCTGGCCCAATTCGCTATTCCAGCCGGAATAACGCTGCGCGATGCGTTTATCCAGCTCGCCATCTTCAATCATGCGCGCTGCAATTTTCAGCGCCAGTGCCATCGTATCCATCGCGCCGATATGACCGTAAAACAGATCATATTTATCA > NZ_LN832404/3725666‑3726237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |