| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 4,506,712 | 0 | G | T | 83.5% | 352.0 / 58.6 | 139 | intergenic (+105/+452) | EK12AG100_RS25865/EK12AG100_RS22290 | hypothetical protein/Fe(3+) dicitrate ABC transporter ATP‑binding protein FecE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (10/13); new base T (54/62); total (64/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAG‑AAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACA > NZ_LN832404/4506425‑4506996 | tGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAG‑AAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCAtgg < 1:501525/290‑1 (MQ=255) 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tCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAACTTTTACCTTCGCGTTTTTCGTTGCAGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGACGTGATCACGACTGGTTTTAAAGCCGCGCCAAAGCCTg > 1:803149/1‑290 (MQ=255) ccGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTACACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTACGGGTTATACAGAAATGTCAGTTAAGCAGATTTCAAAATTGATTGCCGTTCTCACGACTGGTTTGAAAGACGCTACAACGCCTGt > 2:723081/1‑290 (MQ=255) ttCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTACACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTCAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCCCGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACa > 2:977445/1‑290 (MQ=255) | TGCACACCATCCTATTGTTGTGACTGGGAGGCTGCCACCATGCTTCGCGCTTTCCCTCTGGCGAAAAAGGGAGAAGGACGGGCCCGTCTGCCTTCACTTTATGCCAGCTTCGGTAAGCTGGGTGAGACACCGACTCATGAAGATATCATTGATAACAATCGATCCATCAACTGGCCTGTATAACGTGGCTGCCGGTGATTAAGAAAGCTGCACCTACCTAAGTAGTAGCAAACGCACACTTTTTAG‑AAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCAGGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTGATCACGACTGGTTTGAAAGCCGCGCCCAAGCCTGTACA > NZ_LN832404/4506425‑4506996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |