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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 4,598,983 | 0 | C | T | 72.2% | 206.3 / 97.1 | 126 | W117* (TGG→TAG) | EK12AG100_RS22750 | threonine/serine exporter ThrE family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/16); new base T (54/37); total (73/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TTAATCAACGGAAAGCCCGGCACTAGCAGCAGAACGCTGGCGGCCATCGCAATGGTGGGGGTATTGCTGAAAGTGGGGAGTTGCAAAAGCAATCCGGAAATGGTGGTGGCGGCGAAAGCGGTAAGGCAAAAGTTGATCTGTGGATGAAGATGACGTTGTGCCAGCAGCTGGCGGATATACATCGCGGTCGTACTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAC‑GTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTCGACGCTGTCCATTCCCAGTGCCCGACCCAGTCGTGAGGAAAGCTCATCAACCAACGCGCTTTCCGCACCATGTTGCAA > NZ_LN832404/4598698‑4599272 | ttAATCAACGGAAAGCCCGGCACTAGCAGCAGAACGCTGGCGGCCATCGCAATGGTGGGGGTATTGCTGAAAGTGGGGAGTTGCAAAAGCAATCCGGAAATGGTGGTGGCGGCGAAAGCGGTAAGGCAAAAGTTGATCTGTGGATGAAGATGACGTTGTGCCAGCAGCTGGCGGATATACATCGCGGTCGTACTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAACGGCCAACCATTAAGGCTCCCAGCTATCt > 1:783005/1‑290 (MQ=255) 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aGCCATGTTGGGTAACGTAATGGCTGAAGTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGAGGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCGGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAC‑GTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTCGACGCTGTCCATTCCCAGTGCCCGACCCAGTCGTGAGGAAAGCTCATCAACCAACGCGCTTTCCGCACCATGTTg < 2:949258/290‑1 (MQ=255) aGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAC‑GTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTCGACGCTGTCCATTCCCAGTGCCCGACCCAGTCGTGAGGAAAGCTCATCAACCAACGCGCTTTCCGCACCATGTTg > 1:467668/1‑290 (MQ=255) cATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAC‑GTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTCGACGCTGTCCATTCCAAGTGCCCGACCCAGTCGTGAGGAAAGCTCATCCACCAACGCGCTTTCCGCACCATGTTGCaa > 1:928574/1‑290 (MQ=255) | TTAATCAACGGAAAGCCCGGCACTAGCAGCAGAACGCTGGCGGCCATCGCAATGGTGGGGGTATTGCTGAAAGTGGGGAGTTGCAAAAGCAATCCGGAAATGGTGGTGGCGGCGAAAGCGGTAAGGCAAAAGTTGATCTGTGGATGAAGATGACGTTGTGCCAGCAGCTGGCGGATATACATCGCGGTCGTACTGGCAAAGAAGGTGATGACGGCACCATCCCAGCCACCGTTATTGAGTTTACAGAAACAGGCGCAAGAAAGGCCAACCATTAAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAC‑GTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTCGACGCTGTCCATTCCCAGTGCCCGACCCAGTCGTGAGGAAAGCTCATCAACCAACGCGCTTTCCGCACCATGTTGCAA > NZ_LN832404/4598698‑4599272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |