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gTGCTGACATGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGTGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACATTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCg > 2:117511/1‑294 (MQ=255) cTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGACTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGTTTTCTCTTGATTTCAACCTATCATATGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTATTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGttt > 1:581708/1‑294 (MQ=255) tcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGC‑TTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTAt > 2:1101343‑M2/24‑282 (MQ=255) tcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGTGGAAAGATTTGTGAAGTGTTCTG‑AATGCTCTCCGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTGATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCTTGCTTTAGAAGGATTTTCCGTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGCTGTCAAACGATCATAGGTCGTTTCTCTACGATGCGTATTTCTTGAGATTTTAACATTTACAAACTTATTACGTCCTATAATTAACCAGGTTTTATCGTTTTttacc > 2:608177‑M2/24‑292 (MQ=255) aagaaACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACg > 1:178356/1‑294 (MQ=255) cGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGaa < 1:1001775/294‑1 (MQ=255) aTGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCt > 1:20573/1‑294 (MQ=255) ttccTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACAATGTGAATATTATCtg > 1:210214‑M2/5‑294 (MQ=255) tGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCtg < 2:260774/294‑1 (MQ=255) | TCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTG‑AATGCTCTCAGTAA‑ATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGC > NZ_LN832404/575832‑576418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |