New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_LN832404 | 804269 = | 112 (1.140) | 7 (0.080) | 7/538 | NT | 5.7% | intergenic (‑47/+88) | EK12AG100_RS03990/EK12AG100_RS03995 | putative acyl‑CoA thioester hydrolase/tyrosine‑type recombinase/integrase |
? | NZ_LN832404 | = 849699 | 124 (1.340) | intergenic (‑750/+106) | EK12AG100_RS04330/EK12AG100_RS04335 | AAA family ATPase/kinase inhibitor |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTC > NZ_LN832404/849404‑849993 | aTCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATTCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAg > 2:717267‑M2/1‑295 (MQ=255) cTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTCTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTAGTTCAgcttt < 1:877128‑M2/296‑6 (MQ=255) tcttctTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAgcttttttata < 1:235961‑M2/296‑12 (MQ=255) ttcttAGTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTGTCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAgcttttttatact > 2:490996‑M2/1‑283 (MQ=255) aCTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACtt < 1:352131/296‑1 (MQ=255) ggTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAg < 1:733244/296‑1 (MQ=255) aTGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGaa < 2:410842/296‑1 (MQ=255) tGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGaaa > 2:858529/1‑296 (MQ=255) aGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTAATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAgctttcttatcataatttggtcgaaatgg < 2:74091‑M2/296‑30 (MQ=255) cGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCGTGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAg < 1:209475/296‑1 (MQ=255) 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tggCACACAAAGCTTTGCAATGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGATCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGCGCGAAAAGGGAAGGTAAAAAGa > 1:598158/1‑296 (MQ=255) ggCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGAc > 1:79269/1‑296 (MQ=255) caAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAgcttttttatactaagttggcattataaaaaagcattgcttatcaattt < 1:714773‑M2/296‑50 (MQ=255) cACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTATGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTaa < 1:203062/296‑1 (MQ=255) cgggATTGCGAGGTTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAATAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAAt < 2:844529/294‑1 (MQ=255) cTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATa > 2:731854/1‑296 (MQ=255) 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tcGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCAGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGGTTCGCCTTTCGGCGTGGCCGCGCCTCCGTACCCGGGTTTccct > 2:574987/1‑295 (MQ=255) tCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGt < 2:821060/296‑1 (MQ=255) cAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTCCGCCATCGTACCCGGTTTTCCCAAAGTc > 2:481631/1‑296 (MQ=255) | CATCACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTGGATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAA‑TTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTC > NZ_LN832404/849404‑849993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |