| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 577,687 | 0 | C | T | 9.9% | 340.6 / 24.7 | 125 | intergenic (‑301/‑88) | EK12AG100_RS02875/EK12AG100_RS02885 | YlcI/YnfO family protein/DNA‑packaging protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/56); new base T (8/4); total (64/61) | |||||||||||
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Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
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aCCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTG‑CTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGATGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCAGTTCTGCGAGGCCGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTACTG‑AAATGGTATGCTGAAAGGGTTGCTAGAATTGCGAACGAAACGCTCCGCCGGGGAGTTgcagaa > 2:190428/1‑296 (MQ=11) ccctcTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTG‑CTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGAACAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATA‑AAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAAc > 1:98062/1‑296 (MQ=18) cccccTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTG‑CTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGGAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATA‑AAATGGTCTGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAAc > 2:717378/1‑296 (MQ=38) | GCCCCGTATTCAGTGTCGCTGATTTGTATTGTCTGAAGTTGTTTTTACGTTAAGTTGATGCAGATCAATTAATACGATACCTGCGTCATAATTGATTATTTGACGTGGTT‑TGATGGCGTAGATGCACGTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCG‑CGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCATAACTTAATGTATTT‑ATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTG‑CTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGAGTATCCGTACCATTCAGAACTGGCAGGAACAGGGAATGCCCGTTCTGCGAGGCGGTGGCAAGGGTAATGAGGTGCTTTATGACTCTGCCGCCGTCATA‑AAATGGTATGCCGAAAGGGATGCTGAAATTGAGAACGAAAAGCTGCGCCGGGAGGTTGAAGAAC > NZ_LN832404/577393‑577979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |