| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NZ_LN832404 | 2,242,224 | +TAATTTTACCTTGTTGGCCATACAATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGT | 100% | intergenic (‑1/+2) | mglA ← / ← mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_LN832404 | = 2242224 | 0 (0.000) | 100 (1.090) +TAATTTTACCTTGTTGGCCATACAATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGT |
85/450 | NT | 100% | intergenic (‑1/+2) | mglA/mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB |
| ? | NZ_LN832404 | 2242225 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+1) | mglA/mglB | galactose/methyl galactoside ABC transporter ATP‑binding protein MglA/galactose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein MglB | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TTAACTCCTGGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAG‑GAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_LN832404/2241932‑2242224‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCA > NZ_LN832404/2242225‑2242515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTAACTCCTGGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAG‑GAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATAT < 1:431306/294‑1 CTCCTGGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAG‑GAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAATT < 1:11683/294‑1 TGTAACATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTGTCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAAGACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAG‑GAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATATAATTTTACCTT < 2:776618/294‑1 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ATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCCGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCCGCGGACCGACGCCAAACCCCGGACTGCCGGACTTGTTtgtt > 2:288309/1‑290 ATAAGGGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGT > 1:12906/1‑294 GGCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGCCTTGTTGTGTGCTTT > 1:742440/1‑294 GCGCAGTAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGACTGCTGGCCTTGTTGTGTGCTTTC > 1:995518/1‑294 AGTAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCCGCGCTTCTGGCCGTCCACCCACGCCAACCACCCGAACTCCGGACTTTTTGTTCGCTTTCAGCG > 2:1008942/1‑294 TAATAGACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCT > 1:888611/1‑294 GACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAAC < 1:696590/294‑1 ACTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCCCCGGATTTCACCAGCGCCAGAGCTTCTGGCAGCGCATCGCCGCCCAACACCGACATGCTGGCCTTTTTGTGTGCTTTCGGCTCTTCCACC > 2:956472/1‑294 CTGCGCCCAATCAGTCTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAACCG < 1:547683/294‑1 AGTCTTACGTCGTGCTGAATTCAGCCATGTTGTCTTTATCTACGCAAACATAGGGTACGCGGACCACTTTGTGGTCGAGTTTCCAGTTGGTGCAATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCA < 2:1064545/294‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTAACTCCTGGTGTACCATCGAAATACCATTTTCCAGGGCTTCTTTTGCAGAATGGAAATCGATCTCTTTACCCTGGAATAAAATGGTGCCGGAGTCTTTTTGATAAATACCAAACAGGCATTTTAATAATGTCGATTTTCCTGCACCGTTTTCCCCCATTAATGCATGGATAGAATGTGGCCGGACTTTTAAATTAACGTTATCAAGTGCCTTAACACCAG‑GAAAGGACTTGTTGATACCGCTCATTTCCAACAAGTATTCCCCGGAGGACGGAGTCGTTGAGCTGACCATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_LN832404/2241932‑2242224‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTATTTCTTGCTGAATTCAGCCAGGTTGTCTTTATCTACGCCAACATAAGGTACGCGGACCACTTTGTTGTCGATTTTCCAGTTGGTGCCATCAGCCGCACCTTTACCATCGGCCAGGTTTTTCGCCAGATCAAAGGTCGCTTTCGCCTGGTTGTTAGCATCGTTCAGTACGGTGCCCGCCAGTGCACCGGATTTCACCAGCGCCAGCGCTTCTGGCAGCGCATCGACGCCAAACACCGGAATGCTGGACTTGTTGTGTGCTTTCAGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCA > NZ_LN832404/2242225‑2242515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |