| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NZ_LN832404 | 2,523,883 | Δ120 bp | 88.1% | [EK12AG100_RS12585] | [EK12AG100_RS12585] | |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_LN832404 | = 2523882 | 11 (0.090) | 67 (0.790) | 59/414 | NT | 88.1% | noncoding (76/76 nt) | EK12AG100_RS12580 | tRNA‑Val |
| ? | NZ_LN832404 | 2524003 = | 10 (0.120) | intergenic (+1/‑46) | EK12AG100_RS12585/EK12AG100_RS12590 | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
TGGAAAAATTAAGTGGGCGATATTCTATCACTCCCGCCTGATTCCTCAATGTAGTTCGGGTTTCTACCTTACGCATTATTGTTTTCGTTGACAAATTGCGCAACACGGTCTGTTTTGCGATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATG‑TAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTT > NZ_LN832404/2523593‑2524157 | tGGAAAAATTAAGTGGGCGATATTCTATCACTCCCGCCTGATTCCTCAATGTAGTTCGGGTTTCTACCTTACGCATTATTGTTTTCGTTGACAAATTGCTCAACACGGTCTGTTTTGCGATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACGCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActtt > 1:207000‑M1/1‑290 (MQ=255) 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aaaaaTTAAGTGGGCGATATTCTATCACTCCCGCCTGATTCCTCAATGTAGTTCGGGTTTCTACCTTACGCATTATTGTTTTCGTTGACAAATTGCGCAACACGGTCTGTTTTGCGATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActttctc < 1:305538‑M1/294‑8 (MQ=255) aaaaTTAAGTGGGCGATATTCTATCACTCCCGCCTGATTCCTCAATGTAGTTCGGGTTTCTACCTTACGCATTATTGTTTTCGTTGACAAATTGCGCAACACGGTCTGTTTTGCGATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACCATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATACTGCGACTCCACACCGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTCCCCGGAGGGGGTCGGCGGTTCGCTCCCGTCATCCCCCACCCcttcctcc > 2:439492‑M1/1‑286 (MQ=255) aaTTAAGTGGGCGATATTCTATCACTCCCGCCTGATTCCTCAATGTAGTTCGGGTTTCTACCTTACGCATTATTGTTTTCGTTGACAAATTGCGCAACACGGTCTGTTTTGCGATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCActttctcgcc < 1:706219‑M1/294‑11 (MQ=255) 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tCCCGTCATCACCCACCActttctcgccagctaaatttcttgtaaaaatgtgaagtaccgaagtgggtgattagctcagctgggagagcacctcccttacaaggagggggtcggcggttcgatcccgtcatcacccaccacttcgggtcgttagctcagttggtagagcagttgacttttaatcaattggtcgcaggttcgaatcctgcacgacccaccaatgtaaaaaagcgccctaaaggcgcttttttactatctgcgatactccaagattcgaacctgcagcaggtttga > 1:1080205‑M1/1‑18 (MQ=255) | TGGAAAAATTAAGTGGGCGATATTCTATCACTCCCGCCTGATTCCTCAATGTAGTTCGGGTTTCTACCTTACGCATTATTGTTTTCGTTGACAAATTGCGCAACACGGTCTGTTTTGCGATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATG‑TAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTT > NZ_LN832404/2523593‑2524157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |