| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_LN832404 | 2559140 = | 128 (1.100) | 3 (0.030) | 3/566 | NT | 2.3% | coding (137/660 nt) | eutL | ethanolamine utilization microcompartment protein EutL |
| ? | NZ_LN832404 | = 3090672 | 122 (1.050) | coding (712/981 nt) | EK12AG100_RS15340 | type IV pilus twitching motility protein PilT | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCGCATCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAACTGCCTGCGCGGCACCACGCGTATGTAATGTTGCCAGCACCAAATGCCCGGTTTCTGCCGCCGTCAGTGCCAGACGGATTGTCTCGCTGTCACGCAGCTCTCCGAGCAAAATCACATCAGGATCTTCCCGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCAAACATCGCTGGCTGGCATAGAGATATTCAACAGGATCTTCCAGCGTCAGAATATGCGCATCGGCATGTTGATTGAGATAGCCAAC > NZ_LN832404/3090383‑3090963 | gcgcATCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCGTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACACACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGt < 1:43324/294‑1 (MQ=255) gcATCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCACTTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTGGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAATCg > 1:142971/1‑294 (MQ=255) gcATCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCACATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCCCTGCCCGTCCACTACCTGCCAGTTGCTTACGCACGGGGTCTTTTCCCTGCGCCGGCACTGAACCCCCccatcg < 2:884641‑M2/294‑7 (MQ=255) tCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTc < 1:21515/294‑1 (MQ=255) gCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAAct > 1:421370/1‑294 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAActgc > 1:288498/1‑294 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAActgc > 2:445882/1‑294 (MQ=255) aTGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTAAGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCACctgc > 1:728585/1‑294 (MQ=255) tccaCGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGCTAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGGTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGTTGTGTTAATCAGCAATTCAAATTGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAActgcctg < 2:1060043/291‑1 (MQ=255) cAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCGTCCGGGGCTGATAACTCTGCTGAAACGGTATCATCCCGACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAActgcctgc < 2:366235/294‑1 (MQ=255) 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cGCCCCTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGGTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAACTGCCTGCGCGGCACCAcgc < 2:1079868/294‑1 (MQ=255) aCCCGGTGCTGATAACTCTGCGGAAACGTTATCATCCCCACCGGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAACTGCCTGCGCGGCACCACGCGTATGTAATGtt < 1:642417/294‑1 (MQ=255) ggCTGTTGACCCTGCTGAACCGTTTTCACCCCCACCTCGTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCCCCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAACTGCCTGCGCGGCACCACGCGTATGTAATGTTGCCAGc < 2:133585/293‑1 (MQ=255) 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GCGCATCGGGCATGGCAACGTCACAAACGCCCTTCCCCCACCCGGTGCTGATAACTCTGCTGAAACGTTATCATCCCCACCTGCTGCCCGGTTTGAATAACATGCGGTAACTGGTGGGTTTTCCCTTCGCGAATCAAATTCCCCACCGCGGGTGTGTTAATCAGCAATTCAAATAGCGCCACGCGTCCTTCCTGTTTATCCACTTCCAGCTTTTGTGACAGCACTGCCCGTAAACTACCTGCCAGTTGATTACGCACGGGGTCTTTTTCCTGCGCCGGAAATGAATCCACCAGTCGCTCAACTGCCTGCGCGGCACCACGCGTATGTAATGTTGCCAGCACCAAATGCCCGGTTTCTGCCGCCGTCAGTGCCAGACGGATTGTCTCGCTGTCACGCAGCTCTCCGAGCAAAATCACATCAGGATCTTCCCGCAATGCGGCCCGCAATCCCGATGCGAACGTCATACAGTGCAAACCAATTTCCCGCTGCTGGATCAAACATCGCTGGCTGGCATAGAGATATTCAACAGGATCTTCCAGCGTCAGAATATGCGCATCGGCATGTTGATTGAGATAGCCAAC > NZ_LN832404/3090383‑3090963 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |