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| * | NZ_LN832404 | 393,261 | 0 | T | C | 62.3% | 142.2 / 188.6 | 167 | pseudogene (987/1443 nt) | EK12AG100_RS01925 | autotransporter outer membrane beta‑barrel domain‑containing protein |
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Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
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aCGGTAGCACCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTTACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACCAGCTGAGCCACGACATGAACGTTGACGGTCAGTCTTAAGAAAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGCTGCCGGTTATCCTTTCAACTACATCGAAGATCCAGCTCTTAATACATACTTCAAAACTGCTTACGTCTCCGACCATTCTTACaaccatacacgtatta > 2:715843/1‑285 (MQ=255) gtagcaCCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTTACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACCAGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACg > 1:927371/1‑294 (MQ=255) gtaCCAACTCGGAGGTTTGGGGCTTCGGTTTGAAGTCCGGTTACGACTTCAAACTGGGGGATGCTGGTTACGTGACTCCTTACGGCAGCGTTGCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACCAGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCg < 2:483576/294‑1 (MQ=255) | ACGGCGACAACGGCACCATCAACTATGATCAGGATGTTAACGGCATCATGGTCGGTGTTGATACCAAAATTGACGGTAACAACGCTAAGTGGATCGTCGGTGCGGCTGCAGGCTTCGCTAAAGGTGACATGAATGACCGTTCTGGTCAGGTGGATCAAGACAGCCAGACTGCCTACATCTACTCTTCTGCTCACTTCGCGAACAACGTCTTTGTTGATGGTAGCTTGAGCTACTCTCACTTCAACAACGACCTGTCTGCAACCATGAGCAACGGTACTTACGTTGACGGTAGTACCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTTACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACCAGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCG > NZ_LN832404/392969‑393553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |