| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 1,636,567 | 0 | A | T | 46.0% | 57.3 / 310.7 | 198 | T8T (ACA→ACT) | EK12AG100_RS25635 | Rac prophage; protein YnaM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/49); new base T (37/54); total (95/103) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
CATATAGGCTATATCACCTTGATATTTTTCTTTTTCAGATAAAAACTGTTATCTATGTATACTTTTAAACCCAATCCGTGTAGAGTCTCTACATAAGATAGTTTGCAGTTGCCGCTTCAGCTTGCGCCATAAACCGCCTGATTTTTGCTGCCACCTGTTAGCATTCCTGTATACCTGAAACGACAATGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATTGTCAACTATATCATATATAACACATTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACATCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAAAGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTATCCTAGGGGATGCTGTAGTGGAAGTAGCAAAACAGGGAAGACCTATCAATACCAGAACATTGCTTGATTACATTGAA > NZ_LN832404/1636276‑1636860 | tatttatgCTATATCACCTTGCTATTTTTCTGCTTCAGATAAAAACTGTTATCTATGTATACTTTTAAACCCAATCCGTGTAGAGTCTCTGCATAAGATAGTTTGCAGTTGCCACTTCAGCTTGCGCCATAAACCGCCTGATTTTTGCCGCCACCTGTTAGCATTCCTGTATACCTGAAACGACAATGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAGGATAAAAATTGTCAACTATATCATATATAACACATTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACTtc < 2:719616/287‑1 (MQ=255) 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actgtaaaTCACTTCGCTCCTTTTCAACGTCAGCATTTTTAGTCATGCTCTAAAAAAATTAGGGATTTGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGAGGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAAAGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTATCCTAGGGGATGCTGTAGTGGAAGTAGCAAAACAGGGAAGACCTATCAATACCAGAACATTGCtt < 2:1016369/288‑1 (MQ=255) aCTGATAATCACAACGCACCGTATCAAATTCAGCATTTTAAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCAAATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAAAGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTATCCTAGGGGATGCTGTAGTGGAAGTAGCAAAACAGGGAAGACCTATCAATACCAGAACATTGCtt < 2:122775/294‑1 (MQ=255) cTGATAATCACATCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAAAGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTATCCTAGGGGATGCTGTAGTGGAAGTAGCAAAACAGGGAAGACCTATCAATACCAGAACATTGCTTg < 2:470610/294‑1 (MQ=255) | CATATAGGCTATATCACCTTGATATTTTTCTTTTTCAGATAAAAACTGTTATCTATGTATACTTTTAAACCCAATCCGTGTAGAGTCTCTACATAAGATAGTTTGCAGTTGCCGCTTCAGCTTGCGCCATAAACCGCCTGATTTTTGCTGCCACCTGTTAGCATTCCTGTATACCTGAAACGACAATGTTTATCTACGAACTTTAAGAACACCCAAGATAAAAATTGTCAACTATATCATATATAACACATTACTAATTCGAGGCTATATGAACAGCATACTGATAATCACATCTCTCCTTATCATATTCAGCATTTTTAGTCATGCCCTAATAAAATTAGGGATTGGCATATCCAATAACCCAGACAAAACCGATGTATAAGTCAACATATCCTGAATCAGACATACAATATCGCAATGAAAATCAATAATATTTTAAGGAATATCTTCATGAAATCAAAAGACACCCTAAAGTGGTTCCCTGCGCAGCTTCCTGAAGTAAGAATTATCCTAGGGGATGCTGTAGTGGAAGTAGCAAAACAGGGAAGACCTATCAATACCAGAACATTGCTTGATTACATTGAA > NZ_LN832404/1636276‑1636860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |