| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 3,704,460 | 0 | A | C | 84.3% | 290.1 / 38.2 | 105 | intergenic (‑242/+501) | dppA/EK12AG100_RS23155 | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein DppA/RtT sRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/12); new base C (37/51); total (42/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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acacCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACATCGATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATcc < 1:114695/294‑1 (MQ=255) aTCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGATACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTga < 2:868829/294‑1 (MQ=255) aaaacaaaGATCAAAAAAACTTTAAACAGATATTTTCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACAGTTGGGGATTAAGTTGTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGatat < 2:7175/293‑1 (MQ=255) | AGACCAAGCTTCAGCATCCCTGACTTTTTCAAGGAAATACGCATTATTCTGCTCCAATTGTGATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTATCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACAAACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATAT > NZ_LN832404/3704175‑3704751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |