| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 4,543,075 | 0 | T | C | 86.9% | 351.5 / 40.0 | 130 | I502I (ATT→ATC) | fimD | fimbrial biogenesis usher protein FimD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (10/7); new base C (51/61); total (62/68) | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
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ccaacaTCGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACg < 1:445640/293‑1 (MQ=255) caacaTCGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGt < 1:14720/294‑1 (MQ=255) aTTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCCATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGGTATCAACTGAACGCACAGCCATAGCCTGACGCAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCCGATGTTAGCGCTTAACGTCAat > 2:809532/1‑294 (MQ=255) | GGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGGGTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATA > NZ_LN832404/4542784‑4543367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |