| Predicted mutation | |||||||
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| JC | NZ_LN832404 | 1,870,601 | Δ182 bp | 85.7% | [EK12AG100_RS09385] | [EK12AG100_RS09385] | |
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| ? | NZ_LN832404 | 1870783 = | 1 (0.010) | coding (34/1929 nt) | EK12AG100_RS09385 | protein kinase YeaG | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ATGCAAAATTTATGGATGAGTTGTTGATATGCCATTGAAATTAAGAAAGCCGTGCAGGCAAGTTTTCCATTTGCCATCTACGCTTAATTTTGAAGGTGTATCACCGGGCACGTTGTTCTCATCGTCGATAAAATGGCATGAGAGTTGCTGTGTTTTAGCAAGAGACGTCGTTCAGTTTACCTCTTCCGGGAGCCTCTACTATTCATATGAACGGCTCTTAACCTGTGCTAAAAAACGAAAGGACGGCATACCATGAATATATTCGATCACTATCGCCAGCGATATGAAGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGAAGCTGCCAAGGACGAAGAGTTCACACTGCAGGAGTTTCTTACCACTTGTCGGCAAGATCGCAGTGCTTATGCCAACGCGGCTGAGCGGCTATTGATGGCTATCGGTGAGCCTGTC > NZ_LN832404/1870310‑1870893 | aTGCAAAATTTATGGATGAGTTGTTGATATGCCATTGAAATTAAGAAAGCCGTGCAGGCAAGTTTTCCATTTGCCATCTACGCTTAATTTTGAAGGTGTATCACCGGGCACGTTGTTCTCATCGTCGATAAAATGGCATGAGAGTTGCTGTGTTTTAGCAAGAGACGTCGTTCAGTTTACCTCTTCCGGGAGCCTCTACTATTCATATGAACGGCTCTTAACCTGTGCTAAAAAACGAAAGGACGGCATACCATGAATATATTCGATCACTATCGCCAGCGATATGAAGCTAGA < 1:135311‑M2/294‑1 (MQ=255) 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gAAGCTAGATTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtactacacaggaaaagatagcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacag < 1:742897‑M2/294‑204 (MQ=255) aaGCTgccaaggacgaagagttcacactgcaggagtttcttaccacttgtcggcaagatcgcagtgcttatgccaacgcggctgagcggctattgatggctatcggtgagcctgtcatggtcgatacagcccaggaacccagactttctcgactcttttctaaccgggtcattgcacgttatccggcgtttgaagagttttacggcatggaagacgcgcttgaacagattgtctcttatctgaaacacgcggctcaggggcgggaagagaagaaacaaatcctgtatctgctgg > 1:897791‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggt < 1:671589‑M2/294‑206 (MQ=255) gCTgccaaggacgaagagttcacactgcaggagtttcttaccacttgtcggcaagatcgcagtgcttatgccaacgcggctgagcggctattgatggctatcggtgagcctgtcatggtcgatacagcccaggaacccagactttctcgactcttttctaaccgggtcattgcacgttatccggcgtttgaagagttttacggcatggaagacgcgattgaacagattgtctcttatctgaaacacgcggctcaggggctggaagagaagaaacaaatcctgtatctgctgggg > 1:247272‑M1/1‑3 (MQ=255) tgccaagggcgatgcgttgccactggaggagtgtcttaccacatgtcggcaagatcgcagggcttatgccaacgcggctgcgcggctattgatggctctcggtgagcctgtcattggcgatacagcccaggaacccagactgtctcgactcttttctaaccgggtcattgcacggtatccggcgtttgaagagttttacggcatggaagacgcgattgaacagattgtctcttatctgaaacacgcggctcaggggctggaagagaagaaacaaatcctgtatctgctggggcc < 2:611520‑M1/294‑294 (MQ=255) tAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttgt > 1:864960‑M2/1‑86 (MQ=255) | ATGCAAAATTTATGGATGAGTTGTTGATATGCCATTGAAATTAAGAAAGCCGTGCAGGCAAGTTTTCCATTTGCCATCTACGCTTAATTTTGAAGGTGTATCACCGGGCACGTTGTTCTCATCGTCGATAAAATGGCATGAGAGTTGCTGTGTTTTAGCAAGAGACGTCGTTCAGTTTACCTCTTCCGGGAGCCTCTACTATTCATATGAACGGCTCTTAACCTGTGCTAAAAAACGAAAGGACGGCATACCATGAATATATTCGATCACTATCGCCAGCGATATGAAGCTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGAAGCTGCCAAGGACGAAGAGTTCACACTGCAGGAGTTTCTTACCACTTGTCGGCAAGATCGCAGTGCTTATGCCAACGCGGCTGAGCGGCTATTGATGGCTATCGGTGAGCCTGTC > NZ_LN832404/1870310‑1870893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |